RNA–Protein interactions for RNA: YJL069C

UTP18, Transcript of Small-subunit processome protein involved in pre-18S rRNA maturation, yeastyeast

Gene UTP18, Length 1,785 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UTP18YJL069C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
UTP18YJL069C IML1P47170 1584 aa7.17□□□□□ -1.26
UTP18YJL069C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UTP18YJL069C VMR1P38735 1592 aa7.16□□□□□ -1.26
UTP18YJL069C PDR11P40550 1411 aa7.15□□□□□ -1.26
UTP18YJL069C KIP3P53086 805 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
UTP18YJL069C NMA111P53920 997 aa7.15□□□□□ -1.27
UTP18YJL069C PDS5Q04264 1277 aa7.15□□□□□ -1.27
UTP18YJL069C SLI15P38283 698 aa7.14□□□□□ -1.27
UTP18YJL069C IPL1P38991 367 aa7.14□□□□□ -1.27
UTP18YJL069C DNF2Q12675 1612 aa7.14□□□□□ -1.27
UTP18YJL069C ITT1Q04638 464 aa7.13□□□□□ -1.27
UTP18YJL069C NAP1P25293 417 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
UTP18YJL069C DPL1Q05567 589 aa7.12□□□□□ -1.27
UTP18YJL069C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
UTP18YJL069C SPE2P21182 396 aa7.1□□□□□ -1.27
UTP18YJL069C YAP3P38749 330 aa7.09□□□□□ -1.27
UTP18YJL069C PRS1P32895 427 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C TYS1P36421 394 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C ALD4P46367 519 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C KEX1P09620 729 aa7.06□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C EBP2P36049 427 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C DSF2P38213 736 aa7.06□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C BNI1P41832 1953 aa7.05□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C PBS2P08018 668 aa7.05□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C HAP1P0CE41 1502 aa7.04□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C NUP192P47054 1683 aa7.04□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C SRC1Q03707 834 aa7.04□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C TAF8Q03750 510 aa7.04□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C ISU2Q12056 156 aa7.04□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C IOC4Q04213 475 aa7.03□□□□□ -1.28
UTP18YJL069C CAB3P36076 571 aa7.02□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C BCK1Q01389 1478 aa7.02□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C RPP0P05317 312 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C SIS2P36024 562 aa7.01□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C RAD9P14737 1309 aa7.01□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C REF2P42073 533 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C MRX12P47084 519 aa7□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C YPR015CQ12531 247 aa7□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C CAB1Q04430 367 aa7□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C CDC73Q06697 393 aa7□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C GYP1Q08484 637 aa6.99□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C RAM1P22007 431 aa6.98□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C RAS1P01119 309 aa6.97□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C UBP14P38237 781 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C RPN1P38764 993 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C VHR2P40041 505 aa6.97□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C YDR090CQ03193 310 aa6.97□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C CDC45Q08032 650 aa6.97□□□□□ -1.29
UTP18YJL069C VPS27P40343 622 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C IES2P40154 320 aa6.94□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C YRB30P53107 440 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C DIT2P21595 489 aa6.93□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C RAD54P32863 898 aa6.93□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C MAM3Q12296 706 aa6.93□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C COX6P00427 148 aa6.92□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C PDR1P12383 1068 aa6.92□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data6.92□□□□□ -1.3not detected
UTP18YJL069C AMS1P22855 1083 aa6.91□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C RIA1P53893 1110 aa6.91□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C MAK10Q02197 733 aa6.91□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C PSK1P31374 1356 aa6.91□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C FPR3P38911 411 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C YDL144CQ07589 356 aa6.9□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C KRE5P22023 1365 aa6.9□□□□□ -1.3
UTP18YJL069C SAS4Q04003 481 aa6.9□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C DNF3Q12674 1656 aa6.89□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C GLC3P32775 704 aa6.89□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C TRK1P12685 1235 aa6.88□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C PDI1P17967 522 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C RTF1P53064 558 aa6.88□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C RCM1P53972 490 aa6.88□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C TAP42Q04372 366 aa6.88□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C KAR2P16474 682 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C RVB2Q12464 471 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C YML133CQ03099 1374 aa6.87□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C YLL067CQ07888 1374 aa6.87□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C YLL066CQ99208 1374 aa6.87□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C GRX4P32642 244 aa6.87□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C CPS1P27614 576 aa6.85□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C KIC1P38692 1080 aa6.85□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C PPH3P32345 308 aa6.85□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C DMA2P53924 522 aa6.85□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C YEL077CQ3E7X8 1277 aa6.85□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C PEX21P50091 288 aa6.84□□□□□ -1.31
UTP18YJL069C KIN1P13185 1064 aa6.83□□□□□ -1.32
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