RNA–Protein interactions for RNA: YGL006W

PMC1, Transcript of Vacuolar Ca2+ ATPase involved in depleting cytosol of Ca2+ ions, yeast

Gene PMC1, Length 3,522 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMC1	YGL006W	DOS2	P54858	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	TRS33	Q99394	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	CWH41	P53008	833 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	ARP5	P53946	755 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	GCR2	Q01722	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	SLD2	P34252	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	CSI1	Q04368	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	ENV11	P53246	860 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	CIR1	P42940	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	YGR122W	P53272	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	VPS60	Q03390	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	SRC1	Q03707	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	HAP5	Q02516	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	HST1	P53685	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	MSB4	Q12317	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	SWC3	P31376	625 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	PSK1	P31374	1356 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	GYP7	P48365	746 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	PEX14	P53112	341 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMC1	YGL006W	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	JIP3	O13555	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	KEX1	P09620	729 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RIA1	P53893	1110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	PEX19	Q07418	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TLG2	Q08144	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	PET123	P17558	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	PPH3	P32345	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	BDH2	P39713	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	STU2	P46675	888 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TFC8	Q12308	588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	SRT1	Q03175	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RNT1	Q02555	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	IPL1	P38991	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
PMC1	YGL006W	DSD1	P53095	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RIM101	P33400	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	VID28	P40547	921 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	CIN4	P39110	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMC1	YGL006W	ECM1	P39715	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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