RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data5.98□□□□□ -1.45not detected
GCN4YEL009C OSH7P38755 437 aa5.97□□□□□ -1.45
GCN4YEL009C YJR098CP47139 656 aa5.97□□□□□ -1.45
GCN4YEL009C TY1A-MR1Q04215 440 aa5.97□□□□□ -1.45
GCN4YEL009C TCB1Q12466 1186 aa5.96□□□□□ -1.46
GCN4YEL009C YBL086CP38177 466 aa5.94□□□□□ -1.46
GCN4YEL009C FPK1P53739 893 aa5.94□□□□□ -1.46
GCN4YEL009C NSG2P53898 299 aa5.94□□□□□ -1.46
GCN4YEL009C JJJ3P47138 172 aa5.93□□□□□ -1.46
GCN4YEL009C DLD1P32891 587 aa5.91□□□□□ -1.46
GCN4YEL009C IES2P40154 320 aa5.91□□□□□ -1.46
GCN4YEL009C AI1P03875 834 aa5.9□□□□□ -1.46
GCN4YEL009C VAC17P25591 423 aa5.9□□□□□ -1.46
GCN4YEL009C MDJ1P35191 511 aa5.9□□□□□ -1.46
GCN4YEL009C DSF2P38213 736 aa5.9□□□□□ -1.46
GCN4YEL009C SBP1P10080 294 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
GCN4YEL009C TRM1P15565 570 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
GCN4YEL009C THI72Q08579 599 aa5.87□□□□□ -1.47
GCN4YEL009C CCP1P00431 361 aa5.86□□□□□ -1.47
GCN4YEL009C CCT8P47079 568 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
GCN4YEL009C HST2P53686 357 aa5.86□□□□□ -1.47
GCN4YEL009C EMW1P42842 904 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
GCN4YEL009C NUP42P49686 430 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
GCN4YEL009C MMP1Q12372 583 aa5.84□□□□□ -1.47
GCN4YEL009C YPR053CQ6Q5F3 151 aa5.83□□□□□ -1.48
GCN4YEL009C GLN1P32288 370 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
GCN4YEL009C APP1P53933 587 aa5.81□□□□□ -1.48
GCN4YEL009C VTC4P47075 721 aa5.8□□□□□ -1.48
GCN4YEL009C BDS1Q08347 646 aa5.8□□□□□ -1.48
GCN4YEL009C MKS1P34072 584 aa5.79□□□□□ -1.48
GCN4YEL009C CEM1P39525 442 aa5.79□□□□□ -1.48
GCN4YEL009C YFL066CP43538 392 aa5.78□□□□□ -1.48
GCN4YEL009C SCJ1P25303 377 aa5.77□□□□□ -1.49
GCN4YEL009C ADE12P80210 433 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
GCN4YEL009C CDC19P00549 500 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
GCN4YEL009C RPP2BP02400 110 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
GCN4YEL009C DIT2P21595 489 aa5.75□□□□□ -1.49
GCN4YEL009C CUZ1P53899 274 aa5.75□□□□□ -1.49
GCN4YEL009C SKN7P38889 622 aa5.74□□□□□ -1.49
GCN4YEL009C NAM8Q00539 523 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
GCN4YEL009C YMR187CQ03236 431 aa5.74□□□□□ -1.49
GCN4YEL009C DFG5Q05031 458 aa5.74□□□□□ -1.49
GCN4YEL009C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
GCN4YEL009C DAL1P32375 460 aa5.71□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C FBP26P32604 452 aa5.71□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C ATF2P53296 535 aa5.71□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C ESS1P22696 170 aa5.7□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C STE6P12866 1290 aa5.68□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C DIT1P21623 536 aa5.67□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C DLD3P39976 496 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C TDA6Q06466 467 aa5.67□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C RSC30P38781 883 aa5.66□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C UBP15P50101 1230 aa5.66□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C SYT1Q06836 1226 aa5.66□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa5.66□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C ITT1Q04638 464 aa5.65□□□□□ -1.5
GCN4YEL009C FIG4P42837 879 aa5.64□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C YNR014WP53719 212 aa5.64□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C ARG8P18544 423 aa5.63□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C YJU3P28321 313 aa5.63□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C MCX1P38323 520 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C KRE33P53914 1056 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C TEC1P18412 486 aa5.62□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C ISU1Q03020 165 aa5.61□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C MET1P36150 593 aa5.6□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C SBE2P42223 864 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C MSN5P52918 1224 aa5.59□□□□□ -1.51
GCN4YEL009C ATG20Q07528 640 aa5.58□□□□□ -1.52
GCN4YEL009C AHP1P38013 176 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
GCN4YEL009C BOI2P39969 1040 aa5.56□□□□□ -1.52
GCN4YEL009C GUT2P32191 649 aa5.55□□□□□ -1.52
GCN4YEL009C MAC1P35192 417 aa5.55□□□□□ -1.52
GCN4YEL009C FPS1P23900 669 aa5.53□□□□□ -1.52
GCN4YEL009C TAT1P38085 619 aa5.53□□□□□ -1.52
GCN4YEL009C GPM1P00950 247 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C AMN1P38285 549 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C LSB6P42951 607 aa5.52□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C IRC24P40580 263 aa5.51□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C YPR084WQ06821 456 aa5.51□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C YCK2P23292 546 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C YDR215CQ12240 137 aa5.5□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C SLA1P32790 1244 aa5.49□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C SSN3P39073 555 aa5.49□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C CSN12P47130 423 aa5.49□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C STE20Q03497 939 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C RAD59Q12223 238 aa5.47□□□□□ -1.53
GCN4YEL009C KNS1P32350 737 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C TBS1P38114 1094 aa5.46□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C NAF1P53919 492 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C WTM2Q12206 467 aa5.46□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C DAT1P13483 248 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C KTR1P27810 393 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C MRX12P47084 519 aa5.45□□□□□ -1.54
GCN4YEL009C FRA1Q07825 749 aa5.45□□□□□ -1.54
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