RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 NLRP7Q8WX94 980 aa4.53□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 PHOX2BQ99453 314 aa4.53□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 EPAS1Q99814 870 aa4.53□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 AMHR2Q16671 573 aa4.52□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 MS4A1P11836 297 aa4.51□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa4.51□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 TYW1BQ6NUM6 668 aa4.51□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF454Q8N9F8 522 aa4.51□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 FOSBP53539 338 aa4.5□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 GPR153Q6NV75 609 aa4.5□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 ADAM33Q9BZ11 813 aa4.5□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 ERICH6Q7L0X2 663 aa4.49□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 ZDHHC16Q969W1 377 aa4.49□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 PADI6Q6TGC4 694 aa4.48□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 DDRGK1Q96HY6 314 aa4.48□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 JPH4Q96JJ6 628 aa4.48□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 TMUB1Q9BVT8 246 aa4.48□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 LHX6Q9UPM6 363 aa4.48□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 DOK7Q18PE1 504 aa4.47□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 FBXW7Q969H0 707 aa4.47□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM198AQ9UFP1 575 aa4.47□□□□□ -1.69
SPTAN1-232ENST00000636483 C3orf80F5H4A9 247 aa4.46□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 COL9A1P20849 921 aa4.46□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF710Q8N1W2 664 aa4.46□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 ZMYND15Q9H091 742 aa4.46□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 GPCPD1Q9NPB8 672 aa4.46□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 OATP04181 439 aa4.45□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 CLCN1P35523 988 aa4.45□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 PRSS12P56730 875 aa4.45□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 PXYLP1Q8TE99 480 aa4.45□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 CDCA7LQ96GN5 454 aa4.45□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 BEGAINQ9BUH8 593 aa4.45□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.45□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 ADGRG1Q9Y653 693 aa4.45□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 TTC13Q8NBP0 860 aa4.44□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 SCUBE2Q9NQ36 999 aa4.44□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 RIMBP2O15034 1052 aa4.43□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 TSKSQ9UJT2 592 aa4.43□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 SMAPO00193 183 aa4.42□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.42□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 CERKQ8TCT0 537 aa4.42□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa4.42□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 RCCD1A6NED2 376 aa4.41□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 EYA1Q99502 592 aa4.41□□□□□ -1.7
SPTAN1-232ENST00000636483 GOPCQ9HD26 462 aa4.41□□□□□ -1.7
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SPTAN1-232ENST00000636483 PROX2Q3B8N5 592 aa4.4□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa4.4□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 MAMSTRQ6ZN01 415 aa4.4□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 OTUD5Q96G74 571 aa4.4□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 BCL2L12Q9HB09 334 aa4.4□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 PNMA3Q9UL41 463 aa4.4□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 ARID3CA6NKF2 412 aa4.39□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 DDX11L8A8MPP1 907 aa4.39□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 PSEN2P49810 448 aa4.39□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 SH3D19Q5HYK7 790 aa4.39□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 MYSM1Q5VVJ2 828 aa4.39□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 TATDN2Q93075 761 aa4.39□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 CLUAP1Q96AJ1 413 aa4.39□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 TBC1D2Q9BYX2 928 aa4.39□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 RSPH6AQ9H0K4 717 aa4.39□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 KCNK17Q96T54 332 aa4.38□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 ARID3AQ99856 593 aa4.38□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 KIAA1468Q9P260 1216 aa4.38□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 AXIN2Q9Y2T1 843 aa4.38□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa4.37□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 SNPHO15079 494 aa4.37□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 NDUFV2P19404 249 aa4.37□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa4.37□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 POTEEQ6S8J3 1075 aa4.37□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 PACS2Q86VP3 889 aa4.37□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 SPIRE2Q8WWL2 714 aa4.37□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 ARXQ96QS3 562 aa4.37□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 LIMD1Q9UGP4 676 aa4.37□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa4.36□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 CD46P15529 392 aa4.36□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 FLIIQ13045 1269 aa4.36□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 RIC3Q7Z5B4 369 aa4.36□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP4.36□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 C1orf115Q9H7X2 142 aa4.36□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 SNRKQ9NRH2 765 aa4.36□□□□□ -1.71
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