RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622298.1

5S_rRNA.13-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 123 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 HRO43593 1189 aa4.88□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 POTEEQ6S8J3 1075 aa4.88□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 DDX12PQ92771 950 aa4.88□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa4.88□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PHF14O94880 888 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PSEN2P49810 448 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TYW1BQ6NUM6 668 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 P3H3Q8IVL6 736 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 VSIG10Q8N0Z9 540 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ZDHHC16Q969W1 377 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 GRXCR2A6NFK2 248 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 GFRA3O60609 400 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PTPREP23469 700 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ZNF787Q6DD87 383 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 KCNK17Q96T54 332 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 EPAS1Q99814 870 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ADAM33Q9BZ11 813 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 NBR1Q14596 966 aa4.85□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 DMRTA1Q5VZB9 504 aa4.85□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 BCL2L12Q9HB09 334 aa4.85□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 FBXW7Q969H0 707 aa4.84□□□□□ -1.63
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 MAP3K7O43318 606 aa4.82□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa4.82□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 THSD4Q6ZMP0 1018 aa4.82□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SEMA3EO15041 775 aa4.81□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 COL9A1P20849 921 aa4.81□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 OSBPP22059 807 aa4.81□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 WNT2BQ93097 391 aa4.81□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ZBED2Q9BTP6 218 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SLC4A5Q9BY07 1137 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PROX2Q3B8N5 592 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CDHR5Q9HBB8 845 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 KIAA1468Q9P260 1216 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 KCNC4Q03721 635 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CERKQ8TCT0 537 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CDCA7LQ96GN5 454 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 NBPF3Q9H094 633 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 RABGEF1Q9UJ41 708 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 NUTM2FA1L443 756 aa4.74□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PRSS12P56730 875 aa4.74□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TSKSQ9UJT2 592 aa4.74□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 LCE2BO14633 110 aa4.73□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PACS2Q86VP3 889 aa4.73□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SMAPO00193 183 aa4.72□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SLC24A1O60721 1099 aa4.72□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PTGDRQ13258 359 aa4.72□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 FAM198AQ9UFP1 575 aa4.72□□□□□ -1.65
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 FCHSD2O94868 740 aa4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PADI6Q6TGC4 694 aa4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 NYAP1Q6ZVC0 841 aa4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ANKK1Q8NFD2 765 aa4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PNMA3Q9UL41 463 aa4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 NBPF26B4DH59 902 aa4.7□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 C3orf80F5H4A9 247 aa4.7□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.7□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.7□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TTC13Q8NBP0 860 aa4.69□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TATDN2Q93075 761 aa4.69□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 STK17AQ9UEE5 414 aa4.69□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.68□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PRKD2Q9BZL6 878 aa4.68□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SOWAHBA6NEL2 793 aa4.67□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 GNPATO15228 680 aa4.67□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 HIC1Q14526 733 aa4.67□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 FAM161AQ3B820 660 aa4.67□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa4.67□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 GPR37O15354 613 aa4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 BCAMP50895 628 aa4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SAMD7Q7Z3H4 446 aa4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 LRCH3Q96II8 777 aa4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 EYA1Q99502 592 aa4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 FECHP22830 423 aa4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.9 ms