RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613358.4

PGRMC2-208, Transcript of progesterone receptor membrane component 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC2, Length 3,783 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC2-208ENST00000613358 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PGRMC2-208ENST00000613358 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PGRMC2-208ENST00000613358 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PGRMC2-208ENST00000613358 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.85■■□□□ 1.25
PGRMC2-208ENST00000613358 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.83■■□□□ 1.25
PGRMC2-208ENST00000613358 PANK2Q9BZ23 570 aa22.83■■□□□ 1.25
PGRMC2-208ENST00000613358 IFT140Q96RY7 1462 aa22.82■■□□□ 1.24
PGRMC2-208ENST00000613358 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.81■■□□□ 1.24
PGRMC2-208ENST00000613358 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.8■■□□□ 1.24
PGRMC2-208ENST00000613358 CUL7Q14999 1698 aa22.8■■□□□ 1.24
PGRMC2-208ENST00000613358 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
PGRMC2-208ENST00000613358 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
PGRMC2-208ENST00000613358 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PGRMC2-208ENST00000613358 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PGRMC2-208ENST00000613358 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PGRMC2-208ENST00000613358 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.77■■□□□ 1.23
PGRMC2-208ENST00000613358 SEC24BO95487 1268 aa22.76■■□□□ 1.23
PGRMC2-208ENST00000613358 JPH4Q96JJ6 628 aa22.76■■□□□ 1.23
PGRMC2-208ENST00000613358 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.74■■□□□ 1.23
PGRMC2-208ENST00000613358 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.73■■□□□ 1.23
PGRMC2-208ENST00000613358 CLCN1P35523 988 aa22.71■■□□□ 1.23
PGRMC2-208ENST00000613358 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PGRMC2-208ENST00000613358 GOLGA2Q08379 1002 aa22.7■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 RGL3Q3MIN7 710 aa22.7■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.69■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 PANK3Q9H999 370 aa22.69■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.69■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 DAPK1P53355 1430 aa22.67■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.66■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 IGHDP01880 384 aa22.66■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.66■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 BCAR3O75815 825 aa22.66■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.64■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.64■■□□□ 1.22
PGRMC2-208ENST00000613358 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.63■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 USP19O94966 1318 aa22.63■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 ABCC5O15440 1437 aa22.63■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 MCM4P33991 863 aa22.63■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 TRAK2O60296 914 aa22.62■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 ESPNB1AK53 854 aa22.61■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.61■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 COG6Q9Y2V7 657 aa22.61■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 ROCK1Q13464 1354 aa22.6■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.6■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.6■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 KDM5CP41229 1560 aa22.6■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 NUP155O75694 1391 aa22.59■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 MRE11P49959 708 aa22.59■■□□□ 1.21
PGRMC2-208ENST00000613358 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.58■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.57■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 PANK1Q8TE04 598 aa22.57■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.57■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.57■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 IQGAP2Q13576 1575 aa22.56■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 PZPP20742 1482 aa22.56■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.55■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.55■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 ARID3AQ99856 593 aa22.55■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.54■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.54■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.53■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.53■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 MBD5Q9P267 1494 aa22.53■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 ARHGEF11O15085 1522 aa22.53■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 WDR62O43379 1518 aa22.53■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 FSD2A1L4K1 749 aa22.53■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 GRIN2AQ12879 1464 aa22.52■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 APAF1O14727 1248 aa22.52■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PGRMC2-208ENST00000613358 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.51■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 KIF14Q15058 1648 aa22.51■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 SLFN5Q08AF3 891 aa22.5■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.5■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 ERBB4Q15303 1308 aa22.49■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 PLEKHG5O94827 1062 aa22.48■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 TMF1P82094 1093 aa22.48■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 NEUROD2Q15784 382 aa22.48■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.47■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 ADAMTS12P58397 1594 aa22.47■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.47■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.46■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.46■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 PPP2R1AP30153 589 aa22.46■■□□□ 1.19
PGRMC2-208ENST00000613358 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.45■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 SYNJ2O15056 1496 aa22.45■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 HSCBQ8IWL3 235 aa22.44■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 TPM2P07951 284 aa22.44■■□□□ 1.18
PGRMC2-208ENST00000613358 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms