RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	PZP	P20742	1482 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	ADGRL1	O94910	1474 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	NEFL	P07196	543 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	GGT6	Q6P531	493 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	RAPGEF3	O95398	923 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCC1	P33527	1531 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTCFL-222	ENST00000609232	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTCFL-222	ENST00000609232	KANK1	Q14678	1352 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTCFL-222	ENST00000609232	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTCFL-222	ENST00000609232	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTCFL-222	ENST00000609232	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTCFL-222	ENST00000609232	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTCFL-222	ENST00000609232	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTCFL-222	ENST00000609232	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CTCFL-222	ENST00000609232	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.46	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	STK26	Q9P289	416 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CTCFL-222	ENST00000609232	NUTM2F	A1L443	756 aa		13.4	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	USP47	Q96K76	1375 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	A2M	P01023	1474 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	SOX12	O15370	315 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	NEO1	Q92859	1461 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	UNC13B	O14795	1591 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CTCFL-222	ENST00000609232	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	TSPOAP1	O95153	1857 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP10A	O60312	1499 aa		13.27	□□□□□ -0.28
CTCFL-222	ENST00000609232	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	KDM5C	P41229	1560 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	DIP2B	Q9P265	1576 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232		E9PCH4	1651 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	TMF1	P82094	1093 aa		13.22	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms