RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525778.5

SOGA3-203, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 4,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-203ENST00000525778 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.88■■□□□ 1.25
SOGA3-203ENST00000525778 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.87■■□□□ 1.25
SOGA3-203ENST00000525778 CFAP53Q96M91 514 aa22.86■■□□□ 1.25
SOGA3-203ENST00000525778 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.86■■□□□ 1.25
SOGA3-203ENST00000525778 PTPRKQ15262 1439 aa22.85■■□□□ 1.25
SOGA3-203ENST00000525778 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
SOGA3-203ENST00000525778 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.84■■□□□ 1.25
SOGA3-203ENST00000525778 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.83■■□□□ 1.25
SOGA3-203ENST00000525778 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SOGA3-203ENST00000525778 TRAK2O60296 914 aa22.83■■□□□ 1.25
SOGA3-203ENST00000525778 MRE11P49959 708 aa22.83■■□□□ 1.25
SOGA3-203ENST00000525778 PANK1Q8TE04 598 aa22.82■■□□□ 1.24
SOGA3-203ENST00000525778 E9PSI1 815 aa22.81■■□□□ 1.24
SOGA3-203ENST00000525778 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SOGA3-203ENST00000525778 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.79■■□□□ 1.24
SOGA3-203ENST00000525778 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SOGA3-203ENST00000525778 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.79■■□□□ 1.24
SOGA3-203ENST00000525778 BCAR3O75815 825 aa22.78■■□□□ 1.24
SOGA3-203ENST00000525778 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.78■■□□□ 1.24
SOGA3-203ENST00000525778 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.78■■□□□ 1.24
SOGA3-203ENST00000525778 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.77■■□□□ 1.24
SOGA3-203ENST00000525778 MIA2Q96PC5 1412 aa22.76■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.76■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 MORC1Q86VD1 984 aa22.76■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.75■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 PLCB2Q00722 1185 aa22.74■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 ZMYND15Q9H091 742 aa22.74■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.73■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 PTMSP20962 102 aa22.73■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 MCM4P33991 863 aa22.73■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 ESPNB1AK53 854 aa22.72■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.71■■□□□ 1.23
SOGA3-203ENST00000525778 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.7■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 C8orf34Q49A92 452 aa22.68■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.67■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.66■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 SLC24A1O60721 1099 aa22.66■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.66■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 PPP2R1AP30153 589 aa22.65■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.65■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
SOGA3-203ENST00000525778 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 PANK2Q9BZ23 570 aa22.63■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.62■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 CASC1Q6TDU7 716 aa22.62■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 TPM2P07951 284 aa22.61■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 PDE3AQ14432 1141 aa22.6■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.6■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.6■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.59■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.59■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.59■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.59■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.58■■□□□ 1.21
SOGA3-203ENST00000525778 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.58■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 NCAPD3P42695 1498 aa22.57■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 SLFN5Q08AF3 891 aa22.57■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 CLCN1P35523 988 aa22.56■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 APBB1O00213 710 aa22.55■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.55■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 IGHDP01880 384 aa22.55■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 DAPK1P53355 1430 aa22.53■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 LNPKQ9C0E8 428 aa22.53■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.52■■□□□ 1.2
SOGA3-203ENST00000525778 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SOGA3-203ENST00000525778 NGEFQ8N5V2 710 aa22.5■■□□□ 1.19
SOGA3-203ENST00000525778 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SOGA3-203ENST00000525778 SEC24BO95487 1268 aa22.49■■□□□ 1.19
SOGA3-203ENST00000525778 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.48■■□□□ 1.19
SOGA3-203ENST00000525778 MCTP1Q6DN14 999 aa22.47■■□□□ 1.19
SOGA3-203ENST00000525778 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.47■■□□□ 1.19
SOGA3-203ENST00000525778 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.47■■□□□ 1.19
SOGA3-203ENST00000525778 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SOGA3-203ENST00000525778 NESP48681 1621 aa22.46■■□□□ 1.19
SOGA3-203ENST00000525778 ROCK1Q13464 1354 aa22.46■■□□□ 1.19
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