RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523288.5

FAM49B-225, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 2

Gene FAM49B, Length 4,552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-225	ENST00000523288	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	PTMS	P20962	102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	NCOA1	Q15788	1441 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	MRE11	P49959	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	CEP120	Q8N960	986 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62	9e-8	■■■■■ 31.5
FAM49B-225	ENST00000523288	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	CLGN	O14967	610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	RGS3	P49796	1198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	RAD50	Q92878	1312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	MCM5	P33992	734 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	PBRM1	Q86U86	1689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	LAMC1	P11047	1609 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	ESPN	B1AK53	854 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FAM49B-225	ENST00000523288	RIPK4	P57078	832 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	RGS22	Q8NE09	1264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	ARHGEF11	O15085	1522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	MCC	P23508	829 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	MBD5	Q9P267	1494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	KIF14	Q15058	1648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	PSEN1	P49768	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	FAM161A	Q3B820	660 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	HFM1	A2PYH4	1435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	TULP2	O00295	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	NPHP1	O15259	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	KDM5C	P41229	1560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	SYCP1	Q15431	976 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	TMC1	Q8TDI8	760 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-225	ENST00000523288	CUX1	P39880	1505 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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