RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.85■■■■□ 3.81
HOXB3-210ENST00000489475 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.84■■■■□ 3.81
HOXB3-210ENST00000489475 A2MP01023 1474 aa38.8■■■■□ 3.8
HOXB3-210ENST00000489475 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.8■■■■□ 3.8
HOXB3-210ENST00000489475 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.79■■■■□ 3.8
HOXB3-210ENST00000489475 TONSLQ96HA7 1378 aa38.78■■■■□ 3.8
HOXB3-210ENST00000489475 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.77■■■■□ 3.8
HOXB3-210ENST00000489475 KIF3BO15066 747 aa38.75■■■■□ 3.79
HOXB3-210ENST00000489475 ABCA6Q8N139 1617 aa38.75■■■■□ 3.79
HOXB3-210ENST00000489475 DEPDC5O75140 1603 aa38.73■■■■□ 3.79
HOXB3-210ENST00000489475 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.73■■■■□ 3.79
HOXB3-210ENST00000489475 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa38.68■■■■□ 3.78
HOXB3-210ENST00000489475 KANK1Q14678 1352 aa38.68■■■■□ 3.78
HOXB3-210ENST00000489475 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
HOXB3-210ENST00000489475 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.64■■■■□ 3.78
HOXB3-210ENST00000489475 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
HOXB3-210ENST00000489475 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
HOXB3-210ENST00000489475 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
HOXB3-210ENST00000489475 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.58■■■■□ 3.77
HOXB3-210ENST00000489475 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.58■■■■□ 3.77
HOXB3-210ENST00000489475 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
HOXB3-210ENST00000489475 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.57■■■■□ 3.76
HOXB3-210ENST00000489475 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
HOXB3-210ENST00000489475 TET3O43151 1660 aa38.51■■■■□ 3.75
HOXB3-210ENST00000489475 ATP10AO60312 1499 aa38.5■■■■□ 3.75
HOXB3-210ENST00000489475 GGT6Q6P531 493 aa38.48■■■■□ 3.75
HOXB3-210ENST00000489475 L3MBTL2Q969R5 705 aa38.47■■■■□ 3.75
HOXB3-210ENST00000489475 E9PCH4 1651 aa38.45■■■■□ 3.75
HOXB3-210ENST00000489475 PLA2R1Q13018 1463 aa38.44■■■■□ 3.74
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC144AA2RUR9 1427 aa38.44■■■■□ 3.74
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
HOXB3-210ENST00000489475 LMTK2Q8IWU2 1503 aa38.42■■■■□ 3.74
HOXB3-210ENST00000489475 REREQ9P2R6 1566 aa38.41■■■■□ 3.74
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.37■■■■□ 3.73
HOXB3-210ENST00000489475 EFCAB6Q5THR3 1501 aa38.36■■■■□ 3.73
HOXB3-210ENST00000489475 CEP152O94986 1710 aa38.36■■■■□ 3.73
HOXB3-210ENST00000489475 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.35■■■■□ 3.73
HOXB3-210ENST00000489475 PTPRTO14522 1441 aa38.32■■■■□ 3.72
HOXB3-210ENST00000489475 AGLP35573 1532 aa38.32■■■■□ 3.72
HOXB3-210ENST00000489475 ABCC3O15438 1527 aa38.31■■■■□ 3.72
HOXB3-210ENST00000489475 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa38.3■■■■□ 3.72
HOXB3-210ENST00000489475 TRPM2O94759 1503 aa38.29■■■■□ 3.72
HOXB3-210ENST00000489475 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
HOXB3-210ENST00000489475 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.2■■■■□ 3.71
HOXB3-210ENST00000489475 NPATQ14207 1427 aa38.2■■■■□ 3.71
HOXB3-210ENST00000489475 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.18■■■■□ 3.7
HOXB3-210ENST00000489475 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.15■■■■□ 3.7
HOXB3-210ENST00000489475 NBPF8Q3BBV2 869 aa38.15■■■■□ 3.7
HOXB3-210ENST00000489475 RGL3Q3MIN7 710 aa38.14■■■■□ 3.7
HOXB3-210ENST00000489475 CLTCL1P53675 1640 aa38.14■■■■□ 3.7
HOXB3-210ENST00000489475 DCAF11Q8TEB1 546 aa38.13■■■■□ 3.69
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa38.13■■■■□ 3.69
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa38.09■■■■□ 3.69
HOXB3-210ENST00000489475 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.09■■■■□ 3.69
HOXB3-210ENST00000489475 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa38.08■■■■□ 3.69
HOXB3-210ENST00000489475 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.08■■■■□ 3.69
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
HOXB3-210ENST00000489475 MLECQ14165 292 aa38.05■■■■□ 3.68
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
HOXB3-210ENST00000489475 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
HOXB3-210ENST00000489475 UGGT1Q9NYU2 1555 aa38.02■■■■□ 3.68
HOXB3-210ENST00000489475 NOS1P29475 1434 aa38.02■■■■□ 3.68
HOXB3-210ENST00000489475 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.99■■■■□ 3.67
HOXB3-210ENST00000489475 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
HOXB3-210ENST00000489475 KIF1BO60333 1816 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXB3-210ENST00000489475 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
HOXB3-210ENST00000489475 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
HOXB3-210ENST00000489475 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.93■■■■□ 3.66
HOXB3-210ENST00000489475 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP37.93■■■■□ 3.664e-7■■■□□ 18.3
HOXB3-210ENST00000489475 RALGAPBQ86X10 1494 aa37.92■■■■□ 3.66
HOXB3-210ENST00000489475 STAC3Q96MF2 364 aa37.91■■■■□ 3.66
HOXB3-210ENST00000489475 SYNMO15061 1565 aa37.9■■■■□ 3.66
HOXB3-210ENST00000489475 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.9■■■■□ 3.66
HOXB3-210ENST00000489475 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
HOXB3-210ENST00000489475 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
HOXB3-210ENST00000489475 PIK3C2BO00750 1634 aa37.86■■■■□ 3.65
HOXB3-210ENST00000489475 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXB3-210ENST00000489475 ADGRB3O60242 1522 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXB3-210ENST00000489475 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
HOXB3-210ENST00000489475 ERVK-7P63135 1459 aa37.83■■■■□ 3.65
HOXB3-210ENST00000489475 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.65
HOXB3-210ENST00000489475 MROH2AA6NES4 1674 aa37.81■■■■□ 3.64
HOXB3-210ENST00000489475 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa37.79■■■■□ 3.64
HOXB3-210ENST00000489475 CARD11Q9BXL7 1154 aa37.78■■■■□ 3.64
HOXB3-210ENST00000489475 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
HOXB3-210ENST00000489475 ZMYM3Q14202 1370 aa37.78■■■■□ 3.64
HOXB3-210ENST00000489475 IDI1Q13907 227 aa37.77■■■■□ 3.64
HOXB3-210ENST00000489475 MADDQ8WXG6 1647 aa37.74■■■■□ 3.63
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.73■■■■□ 3.63
HOXB3-210ENST00000489475 USP47Q96K76 1375 aa37.73■■■■□ 3.63
HOXB3-210ENST00000489475 MYOM2P54296 1465 aa37.73■■■■□ 3.63
HOXB3-210ENST00000489475 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa37.71■■■■□ 3.63
HOXB3-210ENST00000489475 IFT172Q9UG01 1749 aa37.71■■■■□ 3.63
HOXB3-210ENST00000489475 GPRASP1Q5JY77 1395 aa37.68■■■■□ 3.62
HOXB3-210ENST00000489475 NBPF1Q3BBV0 1214 aa37.66■■■■□ 3.62
HOXB3-210ENST00000489475 PPLO60437 1756 aa37.62■■■■□ 3.61
HOXB3-210ENST00000489475 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.62■■■■□ 3.61
HOXB3-210ENST00000489475 LAMC1P11047 1609 aa37.62■■■■□ 3.61
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.61■■■■□ 3.61
HOXB3-210ENST00000489475 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.59■■■■□ 3.61
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