RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-211ENST00000489450 JPH4Q96JJ6 628 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-211ENST00000489450 EPAS1Q99814 870 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-211ENST00000489450 FOSBP53539 338 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-211ENST00000489450 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-211ENST00000489450 LHX6Q9UPM6 363 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP3K7O43318 606 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 BARGINQ6ZT62 677 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXW7Q969H0 707 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 FCHSD2O94868 740 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 PBX2P40425 430 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 PTGDRQ13258 359 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 GNPATO15228 680 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 FECHP22830 423 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 HIC1Q14526 733 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-211ENST00000489450 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-211ENST00000489450 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP2K5Q13163 448 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-211ENST00000489450 AK7Q96M32 723 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC102AQ96A19 550 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-211ENST00000489450 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-211ENST00000489450 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGAP33O14559 1287 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-211ENST00000489450 COL9A1P20849 921 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-211ENST00000489450 IRF6O14896 467 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 PTPREP23469 700 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 PADI6Q6TGC4 694 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 CERKQ8TCT0 537 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM66O15016 1216 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 NEUROD2Q15784 382 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNK17Q96T54 332 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM161AQ3B820 660 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 PSEN2P49810 448 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 PRSS12P56730 875 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 TK2O00142 265 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 HRO43593 1189 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE4DQ08499 809 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 TTC13Q8NBP0 860 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 HCSTQ9UBK5 93 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 TSKSQ9UJT2 592 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 PROX2Q3B8N5 592 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNH8Q96L42 1107 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 AMHR2Q16671 573 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 PHOX2BQ99453 314 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 C3orf80F5H4A9 247 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 NLRP7Q8WX94 980 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 OATP04181 439 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 SMAPO00193 183 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 PNMA3Q9UL41 463 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 NBPF26B4DH59 902 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 PACS2Q86VP3 889 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 TATDN2Q93075 761 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 EYA1Q99502 592 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-211ENST00000489450 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 RCCD1A6NED2 376 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 CLCN1P35523 988 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 MS4A1P11836 297 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.06□□□□□ -1.28
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