RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.4■■□□□ 1.34
PREB-208ENST00000468045 C8orf34Q49A92 452 aa23.39■■□□□ 1.33
PREB-208ENST00000468045 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.38■■□□□ 1.33
PREB-208ENST00000468045 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.37■■□□□ 1.33
PREB-208ENST00000468045 NUP155O75694 1391 aa23.37■■□□□ 1.33
PREB-208ENST00000468045 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PREB-208ENST00000468045 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.35■■□□□ 1.33
PREB-208ENST00000468045 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.35■■□□□ 1.33
PREB-208ENST00000468045 IQGAP2Q13576 1575 aa23.35■■□□□ 1.33
PREB-208ENST00000468045 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PREB-208ENST00000468045 FAM161AQ3B820 660 aa23.34■■□□□ 1.33
PREB-208ENST00000468045 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.33■■□□□ 1.33
PREB-208ENST00000468045 RGL3Q3MIN7 710 aa23.33■■□□□ 1.32
PREB-208ENST00000468045 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.33■■□□□ 1.32
PREB-208ENST00000468045 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.31■■□□□ 1.32
PREB-208ENST00000468045 PANK3Q9H999 370 aa23.3■■□□□ 1.32
PREB-208ENST00000468045 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.29■■□□□ 1.32
PREB-208ENST00000468045 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PREB-208ENST00000468045 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.29■■□□□ 1.32
PREB-208ENST00000468045 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PREB-208ENST00000468045 E9PCH4 1651 aa23.27■■□□□ 1.32
PREB-208ENST00000468045 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.26■■□□□ 1.31
PREB-208ENST00000468045 POGKQ9P215 609 aa23.25■■□□□ 1.31
PREB-208ENST00000468045 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PREB-208ENST00000468045 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.23■■□□□ 1.31
PREB-208ENST00000468045 ARXQ96QS3 562 aa23.23■■□□□ 1.31
PREB-208ENST00000468045 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.23■■□□□ 1.31
PREB-208ENST00000468045 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.22■■□□□ 1.31
PREB-208ENST00000468045 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.22■■□□□ 1.31
PREB-208ENST00000468045 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.22■■□□□ 1.31
PREB-208ENST00000468045 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PREB-208ENST00000468045 SEC24BO95487 1268 aa23.19■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.18■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.17■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.16■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.16■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 TESK2Q96S53 571 aa23.16■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.15■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 ADGRL2O95490 1459 aa23.15■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 BCAR3O75815 825 aa23.14■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 DISP1Q96F81 1524 aa23.14■■□□□ 1.3
PREB-208ENST00000468045 IGHDP01880 384 aa23.14■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 USP19O94966 1318 aa23.13■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.13■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 GOLGA2Q08379 1002 aa23.12■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 PBRM1Q86U86 1689 aa23.11■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.11■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.11■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.09■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.09■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 ADAMTS12P58397 1594 aa23.09■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 TSPY4P0CV99 314 aa23.08■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 TSPY10P0CW01 314 aa23.08■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.293e-6■■□□□ 11.4
PREB-208ENST00000468045 KIAA0556O60303 1618 aa23.08■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 PPP2R1AP30153 589 aa23.08■■□□□ 1.29
PREB-208ENST00000468045 CEP170Q5SW79 1584 aa23.07■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.06■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.06■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 SLFN5Q08AF3 891 aa23.05■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 ZNF521Q96K83 1311 aa23.05■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.05■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 ERBINQ96RT1 1412 aa23.04■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 TMF1P82094 1093 aa23.04■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.03■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.03■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.03■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 APAF1O14727 1248 aa23.02■■□□□ 1.28
PREB-208ENST00000468045 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.01■■□□□ 1.27
PREB-208ENST00000468045 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.01■■□□□ 1.27
PREB-208ENST00000468045 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.01■■□□□ 1.27
PREB-208ENST00000468045 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PREB-208ENST00000468045 PANK1Q8TE04 598 aa23■■□□□ 1.27
PREB-208ENST00000468045 INSRP06213 1382 aa22.99■■□□□ 1.27
PREB-208ENST00000468045 COG6Q9Y2V7 657 aa22.99■■□□□ 1.27
PREB-208ENST00000468045 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.97■■□□□ 1.27
PREB-208ENST00000468045 A2MP01023 1474 aa22.97■■□□□ 1.27
PREB-208ENST00000468045 PANK2Q9BZ23 570 aa22.96■■□□□ 1.27
PREB-208ENST00000468045 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.95■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.94■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 BECN1Q14457 450 aa22.94■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 PTPRGP23470 1445 aa22.94■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.94■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.93■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.93■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 PLA2R1Q13018 1463 aa22.92■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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