RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427861.2

TOMM20P4-201, Transcript of TOMM20 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene TOMM20P4, Length 435 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20P4-201ENST00000427861 LMOD2Q6P5Q4 547 aa6.52□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.52□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 IFFO2Q5TF58 517 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 TBC1D12O60347 775 aa6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 OXER1Q8TDS5 423 aa6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 WNT2BQ93097 391 aa6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 KCNH8Q96L42 1107 aa6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 Q6ZNB5 142 aa6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 ABCC9O60706 1549 aa6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 GPR37O15354 613 aa6.47□□□□□ -1.37
TOMM20P4-201ENST00000427861 DPYSL4O14531 572 aa6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.45□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.45□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.45□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 ZMYND10O75800 440 aa6.44□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 PTPREP23469 700 aa6.43□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 FOSBP53539 338 aa6.42□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 LCE2BO14633 110 aa6.4□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.4□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 BARGINQ6ZT62 677 aa6.4□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.4□□□□□ -1.38
TOMM20P4-201ENST00000427861 OSBPP22059 807 aa6.39□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 BCAMP50895 628 aa6.38□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 PROX2Q3B8N5 592 aa6.37□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 NBPF3Q9H094 633 aa6.37□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.36□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 EVI5O60447 810 aa6.35□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.35□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 MAP3K9P80192 1104 aa6.34□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.34□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 JPH4Q96JJ6 628 aa6.34□□□□□ -1.39
TOMM20P4-201ENST00000427861 GFRA3O60609 400 aa6.33□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 COL9A1P20849 921 aa6.33□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.33□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 WBP1LQ9NX94 342 aa6.33□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 KCNC4Q03721 635 aa6.32□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.32□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.32□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.31□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 PHF14O94880 888 aa6.31□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.3□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.29□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 PTGDRQ13258 359 aa6.29□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.29□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 EPAS1Q99814 870 aa6.28□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 NISCHQ9Y2I1 1504 aa6.28□□□□□ -1.4
TOMM20P4-201ENST00000427861 MAP2K5Q13163 448 aa6.27□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.27□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 DDX12PQ92771 950 aa6.27□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 AK7Q96M32 723 aa6.27□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.26□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 HIC1Q14526 733 aa6.26□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 LAPTM4AQ15012 233 aa6.26□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 TTC13Q8NBP0 860 aa6.26□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 TRIM66O15016 1216 aa6.25□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 GNPATO15228 680 aa6.25□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 AMHR2Q16671 573 aa6.25□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.25□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.25□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 FCHSD2O94868 740 aa6.24□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 FECHP22830 423 aa6.24□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.24□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.24□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 FBXW7Q969H0 707 aa6.24□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.24□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.24□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 IRF6O14896 467 aa6.23□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 ZNF787Q6DD87 383 aa6.23□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 CCDC102AQ96A19 550 aa6.23□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.23□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
TOMM20P4-201ENST00000427861 PDE4DQ08499 809 aa6.21□□□□□ -1.42
TOMM20P4-201ENST00000427861 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
TOMM20P4-201ENST00000427861 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TOMM20P4-201ENST00000427861 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.2□□□□□ -1.42
TOMM20P4-201ENST00000427861 LRCH3Q96II8 777 aa6.2□□□□□ -1.42
TOMM20P4-201ENST00000427861 NUTM2FA1L443 756 aa6.19□□□□□ -1.42
TOMM20P4-201ENST00000427861 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms