RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411348.1

RNU6-57P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 57, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-57P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF687Q8N1G0 1237 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 ADAM33Q9BZ11 813 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 PTGDRQ13258 359 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 TPRNQ4KMQ1 711 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 MARVELD3Q96A59 401 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM205CA6NFA0 338 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 GNPATO15228 680 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZMYND10O75800 440 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 BARGINQ6ZT62 677 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 HS3ST6Q96QI5 342 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARHGAP33O14559 1287 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
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RNU6-57P-201ENST00000411348 CDHR5Q9HBB8 845 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
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RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC4A5Q9BY07 1137 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 PRSS12P56730 875 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 TTC13Q8NBP0 860 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 KCNK17Q96T54 332 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 TK2O00142 265 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 CDCA7LQ96GN5 454 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 POTEB3A0JP26 581 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 COL9A1P20849 921 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 POTEBQ6S5H4 581 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 POTEEQ6S8J3 1075 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 AK7Q96M32 723 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZBED2Q9BTP6 218 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 NBPF26B4DH59 902 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 IRF6O14896 467 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 OATP04181 439 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 PSEN2P49810 448 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 PADI6Q6TGC4 694 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 PACS2Q86VP3 889 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 RABGEF1Q9UJ41 708 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 POTEMA6NI47 508 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 POTEGQ6S5H5 508 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 CCDC102AQ96A19 550 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 NBPF3Q9H094 633 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 PCDH10Q9P2E7 1040 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 DMRTA1Q5VZB9 504 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC24A3Q9HC58 644 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 TSKSQ9UJT2 592 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 ADGRG1Q9Y653 693 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 FECHP22830 423 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 AMHR2Q16671 573 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 PROX2Q3B8N5 592 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 PXYLP1Q8TE99 480 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 TATDN2Q93075 761 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM198AQ9UFP1 575 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 AXIN2Q9Y2T1 843 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-57P-201ENST00000411348 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRIM66O15016 1216 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 KIAA1468Q9P260 1216 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 HRO43593 1189 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 DNAJB2P25686 324 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 CDAN1Q8IWY9 1227 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 EYA1Q99502 592 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 PNMA3Q9UL41 463 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 CLCN1P35523 988 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.56□□□□□ -1.68
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RNU6-57P-201ENST00000411348 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 RCCD1A6NED2 376 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 PDE4DQ08499 809 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 NECTIN2Q92692 538 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 STAC3Q96MF2 364 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMEM134Q9H6X4 195 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 GPCPD1Q9NPB8 672 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC4A3P48751 1232 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 HDGFP51858 240 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMUB1Q9BVT8 246 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM161AQ3B820 660 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 SULF1Q8IWU6 871 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 PARP9Q8IXQ6 854 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-57P-201ENST00000411348 GOLGA8CPA6NN73 597 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-57P-201ENST00000411348 C3orf80F5H4A9 247 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-57P-201ENST00000411348 SMAPO00193 183 aa4.52□□□□□ -1.69
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