RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399892.6

SEH1L-202, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-202ENST00000399892 HFM1A2PYH4 1435 aa26.59■■□□□ 1.85
SEH1L-202ENST00000399892 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SEH1L-202ENST00000399892 NAIPQ13075 1403 aa26.58■■□□□ 1.85
SEH1L-202ENST00000399892 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.84
SEH1L-202ENST00000399892 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.58■■□□□ 1.84
SEH1L-202ENST00000399892 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SEH1L-202ENST00000399892 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.55■■□□□ 1.84
SEH1L-202ENST00000399892 KANK1Q14678 1352 aa26.54■■□□□ 1.84
SEH1L-202ENST00000399892 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.54■■□□□ 1.84
SEH1L-202ENST00000399892 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SEH1L-202ENST00000399892 DEPDC5O75140 1603 aa26.53■■□□□ 1.84
SEH1L-202ENST00000399892 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.51■■□□□ 1.83
SEH1L-202ENST00000399892 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.51■■□□□ 1.83
SEH1L-202ENST00000399892 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.51■■□□□ 1.83
SEH1L-202ENST00000399892 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SEH1L-202ENST00000399892 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.49■■□□□ 1.83
SEH1L-202ENST00000399892 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SEH1L-202ENST00000399892 PTPRMP28827 1452 aa26.48■■□□□ 1.83
SEH1L-202ENST00000399892 CEP152O94986 1710 aa26.47■■□□□ 1.83
SEH1L-202ENST00000399892 MROH2AA6NES4 1674 aa26.47■■□□□ 1.83
SEH1L-202ENST00000399892 UNC13BO14795 1591 aa26.46■■□□□ 1.83
SEH1L-202ENST00000399892 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.45■■□□□ 1.83
SEH1L-202ENST00000399892 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SEH1L-202ENST00000399892 ABCC3O15438 1527 aa26.44■■□□□ 1.82
SEH1L-202ENST00000399892 ZMYM3Q14202 1370 aa26.43■■□□□ 1.82
SEH1L-202ENST00000399892 TRIM52Q96A61 297 aa26.43■■□□□ 1.82
SEH1L-202ENST00000399892 NUP155O75694 1391 aa26.42■■□□□ 1.82
SEH1L-202ENST00000399892 C3P01024 1663 aa26.42■■□□□ 1.82
SEH1L-202ENST00000399892 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SEH1L-202ENST00000399892 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.39■■□□□ 1.81
SEH1L-202ENST00000399892 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.39■■□□□ 1.81
SEH1L-202ENST00000399892 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.37■■□□□ 1.81
SEH1L-202ENST00000399892 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SEH1L-202ENST00000399892 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.37■■□□□ 1.81
SEH1L-202ENST00000399892 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
SEH1L-202ENST00000399892 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.35■■□□□ 1.81
SEH1L-202ENST00000399892 TET3O43151 1660 aa26.33■■□□□ 1.81
SEH1L-202ENST00000399892 PZPP20742 1482 aa26.32■■□□□ 1.8
SEH1L-202ENST00000399892 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SEH1L-202ENST00000399892 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.3■■□□□ 1.8
SEH1L-202ENST00000399892 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.29■■□□□ 1.8
SEH1L-202ENST00000399892 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SEH1L-202ENST00000399892 NPATQ14207 1427 aa26.27■■□□□ 1.8
SEH1L-202ENST00000399892 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SEH1L-202ENST00000399892 HRCP23327 699 aa26.25■■□□□ 1.79
SEH1L-202ENST00000399892 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.25■■□□□ 1.79
SEH1L-202ENST00000399892 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.24■■□□□ 1.79
SEH1L-202ENST00000399892 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SEH1L-202ENST00000399892 E9PCH4 1651 aa26.23■■□□□ 1.79
SEH1L-202ENST00000399892 ERVK-7P63135 1459 aa26.22■■□□□ 1.79
SEH1L-202ENST00000399892 TNRQ92752 1358 aa26.21■■□□□ 1.79
SEH1L-202ENST00000399892 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.2■■□□□ 1.78
SEH1L-202ENST00000399892 PKD2Q13563 968 aa26.19■■□□□ 1.78
SEH1L-202ENST00000399892 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.19■■□□□ 1.78
SEH1L-202ENST00000399892 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.19■■□□□ 1.78
SEH1L-202ENST00000399892 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.15■■□□□ 1.78
SEH1L-202ENST00000399892 NOS1P29475 1434 aa26.12■■□□□ 1.77
SEH1L-202ENST00000399892 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.12■■□□□ 1.77
SEH1L-202ENST00000399892 NLRP1Q9C000 1473 aa26.11■■□□□ 1.77
SEH1L-202ENST00000399892 SYNMO15061 1565 aa26.09■■□□□ 1.77
SEH1L-202ENST00000399892 FOXD1Q16676 465 aa26.09■■□□□ 1.77
SEH1L-202ENST00000399892 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SEH1L-202ENST00000399892 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.08■■□□□ 1.76
SEH1L-202ENST00000399892 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.07■■□□□ 1.76
SEH1L-202ENST00000399892 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SEH1L-202ENST00000399892 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.07■■□□□ 1.76
SEH1L-202ENST00000399892 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.06■■□□□ 1.76
SEH1L-202ENST00000399892 IDI1Q13907 227 aa26.04■■□□□ 1.76
SEH1L-202ENST00000399892 PTPRTO14522 1441 aa26.04■■□□□ 1.76
SEH1L-202ENST00000399892 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.03■■□□□ 1.76
SEH1L-202ENST00000399892 TRPM2O94759 1503 aa26.02■■□□□ 1.76
SEH1L-202ENST00000399892 PIK3C2BO00750 1634 aa26.02■■□□□ 1.76
SEH1L-202ENST00000399892 HSPA2P54652 639 aa26.01■■□□□ 1.75
SEH1L-202ENST00000399892 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SEH1L-202ENST00000399892 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SEH1L-202ENST00000399892 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.98■■□□□ 1.75
SEH1L-202ENST00000399892 PLA2R1Q13018 1463 aa25.97■■□□□ 1.75
SEH1L-202ENST00000399892 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.96■■□□□ 1.75
SEH1L-202ENST00000399892 CLTCL1P53675 1640 aa25.96■■□□□ 1.75
SEH1L-202ENST00000399892 KIF1BO60333 1816 aa25.95■■□□□ 1.74
SEH1L-202ENST00000399892 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SEH1L-202ENST00000399892 ADGRB3O60242 1522 aa25.94■■□□□ 1.74
SEH1L-202ENST00000399892 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.93■■□□□ 1.74
SEH1L-202ENST00000399892 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.9■■□□□ 1.74
SEH1L-202ENST00000399892 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SEH1L-202ENST00000399892 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.89■■□□□ 1.74
SEH1L-202ENST00000399892 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SEH1L-202ENST00000399892 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.85■■□□□ 1.73
SEH1L-202ENST00000399892 EID1Q9Y6B2 187 aa25.85■■□□□ 1.73
SEH1L-202ENST00000399892 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.84■■□□□ 1.73
SEH1L-202ENST00000399892 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SEH1L-202ENST00000399892 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SEH1L-202ENST00000399892 SLIT1O75093 1534 aa25.82■■□□□ 1.72
SEH1L-202ENST00000399892 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.82■■□□□ 1.72
SEH1L-202ENST00000399892 STRCQ7RTU9 1775 aa25.81■■□□□ 1.72
SEH1L-202ENST00000399892 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.81■■□□□ 1.72
SEH1L-202ENST00000399892 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SEH1L-202ENST00000399892 RGL3Q3MIN7 710 aa25.79■■□□□ 1.72
SEH1L-202ENST00000399892 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.79■■□□□ 1.72
SEH1L-202ENST00000399892 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.78■■□□□ 1.72
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