RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
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LMO2-202ENST00000395833 RICTORQ6R327 1708 aa42.48■■■■■ 4.39
LMO2-202ENST00000395833 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 A2MP01023 1474 aa42.42■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 DEPDC5O75140 1603 aa42.39■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 ABCA6Q8N139 1617 aa42.39■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 KIF3BO15066 747 aa42.38■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.36■■■■■ 4.37
LMO2-202ENST00000395833 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
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LMO2-202ENST00000395833 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.29■■■■■ 4.36
LMO2-202ENST00000395833 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.27■■■■■ 4.36
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LMO2-202ENST00000395833 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.22■■■■■ 4.35
LMO2-202ENST00000395833 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.22■■■■■ 4.35
LMO2-202ENST00000395833 L3MBTL2Q969R5 705 aa42.22■■■■■ 4.35
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LMO2-202ENST00000395833 TET3O43151 1660 aa42.16■■■■■ 4.34
LMO2-202ENST00000395833 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.15■■■■■ 4.34
LMO2-202ENST00000395833 E9PCH4 1651 aa42.12■■■■■ 4.33
LMO2-202ENST00000395833 CCDC144AA2RUR9 1427 aa42.12■■■■■ 4.33
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LMO2-202ENST00000395833 ATP10AO60312 1499 aa42.06■■■■■ 4.32
LMO2-202ENST00000395833 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
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LMO2-202ENST00000395833 CEP152O94986 1710 aa42.02■■■■■ 4.32
LMO2-202ENST00000395833 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.02■■■■■ 4.32
LMO2-202ENST00000395833 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
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LMO2-202ENST00000395833 PTPRTO14522 1441 aa41.93■■■■■ 4.3
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LMO2-202ENST00000395833 ABCC3O15438 1527 aa41.91■■■■■ 4.3
LMO2-202ENST00000395833 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.91■■■■■ 4.3
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LMO2-202ENST00000395833 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
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LMO2-202ENST00000395833 NPATQ14207 1427 aa41.78■■■■■ 4.28
LMO2-202ENST00000395833 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.77■■■■■ 4.28
LMO2-202ENST00000395833 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.76■■■■■ 4.28
LMO2-202ENST00000395833 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.72■■■■■ 4.27
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LMO2-202ENST00000395833 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.67■■■■■ 4.26
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LMO2-202ENST00000395833 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.59■■■■■ 4.25
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LMO2-202ENST00000395833 USP47Q96K76 1375 aa41.43■■■■■ 4.22
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LMO2-202ENST00000395833 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.23■■■■■ 4.19
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LMO2-202ENST00000395833 PPLO60437 1756 aa41.21■■■■■ 4.19
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