RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.25□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 RALBP1Q15311 655 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 NUP160Q12769 1436 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 PANK3Q9H999 370 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 KIF7Q2M1P5 1343 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC7Q96M83 1385 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 RAPGEF3O95398 923 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 WASHC2AQ641Q2 1341 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 MAPKBP1O60336 1514 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 NCOA1Q15788 1441 aa13.21□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 SOX12O15370 315 aa13.2□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 ADGRL1O94910 1474 aa13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 NUDCQ9Y266 331 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 CD109Q6YHK3 1445 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 LMOD2Q6P5Q4 547 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 FANCAO15360 1455 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TTPAL-202ENST00000372904 CHD1O14646 1710 aa13.14□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.14□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.13□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 EID1Q9Y6B2 187 aa13.13□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 NLRP13Q86W25 1043 aa13.12□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 NUTM2FA1L443 756 aa13.12□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 ASXL2Q76L83 1435 aa13.12□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.12□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa13.12□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 ABCC2Q92887 1545 aa13.11□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 PPP4R2Q9NY27 417 aa13.11□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 PLCH2O75038 1416 aa13.11□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13.1□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 ERBINQ96RT1 1412 aa13.1□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 EVC2Q86UK5 1308 aa13.09□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 TERF2IPQ9NYB0 399 aa13.09□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.31
TTPAL-202ENST00000372904 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.05□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 CABP2Q9NPB3 220 aa13.04□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.04□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 STAC3Q96MF2 364 aa13.04□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 RCAN3Q9UKA8 241 aa13.04□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 ABCA8O94911 1581 aa13.03□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.03□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.02□□□□□ -0.32
TTPAL-202ENST00000372904 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.02□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 A0A0G2JS52 829 aa13.01□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.01□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 MYH16Q9H6N6 1097 aa13□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.99□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 MYT1Q01538 1121 aa12.98□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC184Q52MB2 194 aa12.98□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 GOLGA2Q08379 1002 aa12.98□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 KDM6BO15054 1643 aa12.98□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 PZPP20742 1482 aa12.97□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 PRAM1Q96QH2 718 aa12.97□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 MYO5CQ9NQX4 1742 aa12.96□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP12.96□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.96□□□□□ -0.33
TTPAL-202ENST00000372904 RGS3P49796 1198 aa12.96□□□□□ -0.34
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa12.95□□□□□ -0.34
TTPAL-202ENST00000372904 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa12.94□□□□□ -0.34
TTPAL-202ENST00000372904 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TTPAL-202ENST00000372904 SLC52A1Q9NWF4 448 aa12.94□□□□□ -0.34
TTPAL-202ENST00000372904 ADGRL2O95490 1459 aa12.94□□□□□ -0.34
TTPAL-202ENST00000372904 ABCC10Q5T3U5 1492 aa12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms