RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
CRIP1-201ENST00000330233 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.38■■■■■ 4.05
CRIP1-201ENST00000330233 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
CRIP1-201ENST00000330233 PTPRMP28827 1452 aa40.35■■■■■ 4.05
CRIP1-201ENST00000330233 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.31■■■■■ 4.04
CRIP1-201ENST00000330233 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.31■■■■■ 4.04
CRIP1-201ENST00000330233 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
CRIP1-201ENST00000330233 DEPDC5O75140 1603 aa40.27■■■■■ 4.04
CRIP1-201ENST00000330233 MROH2AA6NES4 1674 aa40.27■■■■■ 4.04
CRIP1-201ENST00000330233 HFM1A2PYH4 1435 aa40.25■■■■■ 4.03
CRIP1-201ENST00000330233 NAIPQ13075 1403 aa40.25■■■■■ 4.03
CRIP1-201ENST00000330233 KANK1Q14678 1352 aa40.24■■■■■ 4.03
CRIP1-201ENST00000330233 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.24■■■■■ 4.03
CRIP1-201ENST00000330233 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.24■■■■■ 4.03
CRIP1-201ENST00000330233 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.24■■■■■ 4.03
CRIP1-201ENST00000330233 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.23■■■■■ 4.03
CRIP1-201ENST00000330233 ZMYM3Q14202 1370 aa40.22■■■■■ 4.03
CRIP1-201ENST00000330233 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
CRIP1-201ENST00000330233 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
CRIP1-201ENST00000330233 C3P01024 1663 aa40.18■■■■■ 4.02
CRIP1-201ENST00000330233 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
CRIP1-201ENST00000330233 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.17■■■■■ 4.02
CRIP1-201ENST00000330233 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
CRIP1-201ENST00000330233 ABCC3O15438 1527 aa40.15■■■■■ 4.02
CRIP1-201ENST00000330233 CEP152O94986 1710 aa40.13■■■■■ 4.01
CRIP1-201ENST00000330233 UNC13BO14795 1591 aa40.12■■■■■ 4.01
CRIP1-201ENST00000330233 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.1■■■■■ 4.01
CRIP1-201ENST00000330233 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.04■■■■■ 4
CRIP1-201ENST00000330233 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.04■■■■■ 4
CRIP1-201ENST00000330233 NUP155O75694 1391 aa40.04■■■■■ 4
CRIP1-201ENST00000330233 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.03■■■■■ 4
CRIP1-201ENST00000330233 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
CRIP1-201ENST00000330233 NPATQ14207 1427 aa40.02■■■■■ 4
CRIP1-201ENST00000330233 PZPP20742 1482 aa40.01■■■■■ 4
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa39.99■■■■□ 3.99
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
CRIP1-201ENST00000330233 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.98■■■■□ 3.99
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM52Q96A61 297 aa39.95■■■■□ 3.99
CRIP1-201ENST00000330233 TET3O43151 1660 aa39.93■■■■□ 3.98
CRIP1-201ENST00000330233 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
CRIP1-201ENST00000330233 EFCAB6Q5THR3 1501 aa39.89■■■■□ 3.98
CRIP1-201ENST00000330233 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.88■■■■□ 3.98
CRIP1-201ENST00000330233 HRCP23327 699 aa39.86■■■■□ 3.97
CRIP1-201ENST00000330233 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.85■■■■□ 3.97
CRIP1-201ENST00000330233 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
CRIP1-201ENST00000330233 TNRQ92752 1358 aa39.83■■■■□ 3.97
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.82■■■■□ 3.97
CRIP1-201ENST00000330233 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.82■■■■□ 3.97
CRIP1-201ENST00000330233 ERVK-7P63135 1459 aa39.82■■■■□ 3.96
CRIP1-201ENST00000330233 E9PCH4 1651 aa39.78■■■■□ 3.96
CRIP1-201ENST00000330233 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
CRIP1-201ENST00000330233 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.74■■■■□ 3.95
CRIP1-201ENST00000330233 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.73■■■■□ 3.95
CRIP1-201ENST00000330233 NOS1P29475 1434 aa39.71■■■■□ 3.95
CRIP1-201ENST00000330233 NLRP1Q9C000 1473 aa39.7■■■■□ 3.95
CRIP1-201ENST00000330233 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.68■■■■□ 3.94
CRIP1-201ENST00000330233 PKD2Q13563 968 aa39.67■■■■□ 3.94
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
CRIP1-201ENST00000330233 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.66■■■■□ 3.94
CRIP1-201ENST00000330233 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.65■■■■□ 3.94
CRIP1-201ENST00000330233 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
CRIP1-201ENST00000330233 SYNMO15061 1565 aa39.6■■■■□ 3.93
CRIP1-201ENST00000330233 HSPA2P54652 639 aa39.59■■■■□ 3.93
CRIP1-201ENST00000330233 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.58■■■■□ 3.93
CRIP1-201ENST00000330233 IDI1Q13907 227 aa39.58■■■■□ 3.93
CRIP1-201ENST00000330233 PTPRTO14522 1441 aa39.56■■■■□ 3.92
CRIP1-201ENST00000330233 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
CRIP1-201ENST00000330233 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.54■■■■□ 3.92
CRIP1-201ENST00000330233 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.5■■■■□ 3.91
CRIP1-201ENST00000330233 PIK3C2BO00750 1634 aa39.49■■■■□ 3.91
CRIP1-201ENST00000330233 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.47■■■■□ 3.91
CRIP1-201ENST00000330233 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
CRIP1-201ENST00000330233 FOXD1Q16676 465 aa39.46■■■■□ 3.91
CRIP1-201ENST00000330233 TRPM2O94759 1503 aa39.44■■■■□ 3.9
CRIP1-201ENST00000330233 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.41■■■■□ 3.9
CRIP1-201ENST00000330233 PLA2R1Q13018 1463 aa39.41■■■■□ 3.9
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRB3O60242 1522 aa39.37■■■■□ 3.89
CRIP1-201ENST00000330233 STRCQ7RTU9 1775 aa39.36■■■■□ 3.89
CRIP1-201ENST00000330233 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
CRIP1-201ENST00000330233 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.34■■■■□ 3.89
CRIP1-201ENST00000330233 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.34■■■■□ 3.89
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.34■■■■□ 3.89
CRIP1-201ENST00000330233 KIF1BO60333 1816 aa39.33■■■■□ 3.89
CRIP1-201ENST00000330233 CLTCL1P53675 1640 aa39.33■■■■□ 3.89
CRIP1-201ENST00000330233 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.32■■■■□ 3.88
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.29■■■■□ 3.88
CRIP1-201ENST00000330233 SLIT1O75093 1534 aa39.28■■■■□ 3.88
CRIP1-201ENST00000330233 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.28■■■■□ 3.88
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.28■■■■□ 3.88
CRIP1-201ENST00000330233 EID1Q9Y6B2 187 aa39.27■■■■□ 3.88
CRIP1-201ENST00000330233 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.26■■■■□ 3.88
CRIP1-201ENST00000330233 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.24■■■■□ 3.87
CRIP1-201ENST00000330233 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.23■■■■□ 3.87
CRIP1-201ENST00000330233 LTKP29376 864 aa39.17■■■■□ 3.86
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
CRIP1-201ENST00000330233 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP39.17■■■■□ 3.86
CRIP1-201ENST00000330233 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 664.3 ms