RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299563.4

RNF169-201, Transcript of ring finger protein 169, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF169, Length 7,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169-201ENST00000299563 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.53■■□□□ 1.04
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RNF169-201ENST00000299563 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.52■■□□□ 1.04
RNF169-201ENST00000299563 GOLGA3Q08378 1498 aa21.52■■□□□ 1.04
RNF169-201ENST00000299563 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.51■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.51■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.5■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 RAD21O60216 631 aa21.5■■□□□ 1.03
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RNF169-201ENST00000299563 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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RNF169-201ENST00000299563 RUFY1Q96T51 708 aa21.49■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.49■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 CDR1P51861 262 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 TRIM29Q14134 588 aa21.47■■□□□ 1.03
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RNF169-201ENST00000299563 AK7Q96M32 723 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 ZNF592Q92610 1267 aa21.46■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 MCTP1Q6DN14 999 aa21.45■■□□□ 1.03
RNF169-201ENST00000299563 ERCC6Q03468 1493 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF169-201ENST00000299563 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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RNF169-201ENST00000299563 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.43■■□□□ 1.02
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RNF169-201ENST00000299563 RILPL2Q969X0 211 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF169-201ENST00000299563 HOMER1Q86YM7 354 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF169-201ENST00000299563 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.41■■□□□ 1.02
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RNF169-201ENST00000299563 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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RNF169-201ENST00000299563 EPS15P42566 896 aa21.37■■□□□ 1.01
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RNF169-201ENST00000299563 CEP162Q5TB80 1403 aa21.36■■□□□ 1.01
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RNF169-201ENST00000299563 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.36■■□□□ 1.01
RNF169-201ENST00000299563 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.35■■□□□ 1.01
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RNF169-201ENST00000299563 ACBD3Q9H3P7 528 aa21.35■■□□□ 1.01
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RNF169-201ENST00000299563 KIF27Q86VH2 1401 aa21.29■■□□□ 1
RNF169-201ENST00000299563 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.29■■□□□ 1
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RNF169-201ENST00000299563 FBXW7Q969H0 707 aa21.28■■□□□ 1
RNF169-201ENST00000299563 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.28■■□□□ 1
RNF169-201ENST00000299563 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.28■■□□□ 1
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RNF169-201ENST00000299563 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
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RNF169-201ENST00000299563 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
RNF169-201ENST00000299563 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.21■□□□□ 0.99
RNF169-201ENST00000299563 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.2■□□□□ 0.99
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RNF169-201ENST00000299563 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.2■□□□□ 0.98
RNF169-201ENST00000299563 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.2■□□□□ 0.98
RNF169-201ENST00000299563 CAGE1Q8TC20 777 aa21.2■□□□□ 0.98
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