RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa12.56□□□□□ -0.4
PDCL2-201ENST00000295645 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PDCL2-201ENST00000295645 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa12.53□□□□□ -0.4
PDCL2-201ENST00000295645 DDX12PQ92771 950 aa12.53□□□□□ -0.4
PDCL2-201ENST00000295645 ZBED2Q9BTP6 218 aa12.53□□□□□ -0.4
PDCL2-201ENST00000295645 P3H3Q8IVL6 736 aa12.52□□□□□ -0.41
PDCL2-201ENST00000295645 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.5□□□□□ -0.41
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PDCL2-201ENST00000295645 NBR1Q14596 966 aa12.48□□□□□ -0.41
PDCL2-201ENST00000295645 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
PDCL2-201ENST00000295645 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
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PDCL2-201ENST00000295645 COL9A1P20849 921 aa12.44□□□□□ -0.42
PDCL2-201ENST00000295645 KCNV2Q8TDN2 545 aa12.44□□□□□ -0.42
PDCL2-201ENST00000295645 RABGEF1Q9UJ41 708 aa12.44□□□□□ -0.42
PDCL2-201ENST00000295645 GRXCR2A6NFK2 248 aa12.43□□□□□ -0.42
PDCL2-201ENST00000295645 MAP3K7O43318 606 aa12.43□□□□□ -0.42
PDCL2-201ENST00000295645 CERKQ8TCT0 537 aa12.43□□□□□ -0.42
PDCL2-201ENST00000295645 HCSTQ9UBK5 93 aa12.43□□□□□ -0.42
PDCL2-201ENST00000295645 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
PDCL2-201ENST00000295645 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
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PDCL2-201ENST00000295645 PROX2Q3B8N5 592 aa12.37□□□□□ -0.43
PDCL2-201ENST00000295645 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.36□□□□□ -0.43
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PDCL2-201ENST00000295645 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
PDCL2-201ENST00000295645 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.35□□□□□ -0.43
PDCL2-201ENST00000295645 PACS2Q86VP3 889 aa12.34□□□□□ -0.43
PDCL2-201ENST00000295645 VSIG10Q8N0Z9 540 aa12.31□□□□□ -0.44
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PDCL2-201ENST00000295645 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
PDCL2-201ENST00000295645 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.29□□□□□ -0.44
PDCL2-201ENST00000295645 THSD4Q6ZMP0 1018 aa12.28□□□□□ -0.44
PDCL2-201ENST00000295645 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PDCL2-201ENST00000295645 ANKK1Q8NFD2 765 aa12.27□□□□□ -0.45
PDCL2-201ENST00000295645 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
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PDCL2-201ENST00000295645 SMYD5Q6GMV2 418 aa12.25□□□□□ -0.45
PDCL2-201ENST00000295645 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.25□□□□□ -0.45
PDCL2-201ENST00000295645 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
PDCL2-201ENST00000295645 NBPF26B4DH59 902 aa12.22□□□□□ -0.45
PDCL2-201ENST00000295645 SEMA3EO15041 775 aa12.22□□□□□ -0.45
PDCL2-201ENST00000295645 PTPN5P54829 565 aa12.22□□□□□ -0.45
PDCL2-201ENST00000295645 CDHR5Q9HBB8 845 aa12.21□□□□□ -0.45
PDCL2-201ENST00000295645 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PDCL2-201ENST00000295645 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
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PDCL2-201ENST00000295645 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
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PDCL2-201ENST00000295645 TTC13Q8NBP0 860 aa12.19□□□□□ -0.46
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PDCL2-201ENST00000295645 FAM198AQ9UFP1 575 aa12.16□□□□□ -0.46
PDCL2-201ENST00000295645 NUTM2FA1L443 756 aa12.15□□□□□ -0.46
PDCL2-201ENST00000295645 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PDCL2-201ENST00000295645 PNMA3Q9UL41 463 aa12.15□□□□□ -0.46
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PDCL2-201ENST00000295645 FCHSD2O94868 740 aa12.12□□□□□ -0.47
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PDCL2-201ENST00000295645 NUDT18Q6ZVK8 323 aa12.12□□□□□ -0.47
PDCL2-201ENST00000295645 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
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PDCL2-201ENST00000295645 SMAPO00193 183 aa12.09□□□□□ -0.47
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PDCL2-201ENST00000295645 HPS5Q9UPZ3 1129 aa12.07□□□□□ -0.48
PDCL2-201ENST00000295645 SLC4A3P48751 1232 aa12.06□□□□□ -0.48
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PDCL2-201ENST00000295645 HIC1Q14526 733 aa12.06□□□□□ -0.48
PDCL2-201ENST00000295645 EYA1Q99502 592 aa12.06□□□□□ -0.48
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PDCL2-201ENST00000295645 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
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PDCL2-201ENST00000295645 SLF2Q8IX21 1173 aa12.01□□□□□ -0.49
PDCL2-201ENST00000295645 ADGRG1Q9Y653 693 aa12.01□□□□□ -0.49
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PDCL2-201ENST00000295645 GNPATO15228 680 aa11.98□□□□□ -0.49
PDCL2-201ENST00000295645 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PDCL2-201ENST00000295645 KCNC4Q03721 635 aa11.95□□□□□ -0.5
PDCL2-201ENST00000295645 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.95□□□□□ -0.5
PDCL2-201ENST00000295645 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PDCL2-201ENST00000295645 PRR14Q9BWN1 585 aa11.94□□□□□ -0.5
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.94□□□□□ -0.5
PDCL2-201ENST00000295645 RNF40O75150 1001 aa11.93□□□□□ -0.5
PDCL2-201ENST00000295645 RGS20O76081 388 aa11.93□□□□□ -0.5
PDCL2-201ENST00000295645 RCCD1A6NED2 376 aa11.92□□□□□ -0.5
PDCL2-201ENST00000295645 GPR37O15354 613 aa11.92□□□□□ -0.5
PDCL2-201ENST00000295645 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.91□□□□□ -0.5
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