RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 CCDC39Q9UFE4 941 aa19.83■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.83■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa19.83■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 HDGFP51858 240 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 FOXD1Q16676 465 aa19.82■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.82■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 KIF15Q9NS87 1388 aa19.82■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 TPM3P06753 285 aa19.81■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa19.81■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 TRAK2O60296 914 aa19.8■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 CALRP27797 417 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.8■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.8■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.8■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa19.79■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.79■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 BECN2A8MW95 431 aa19.78■□□□□ 0.76
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CTIF-201ENST00000256413 MSH5O43196 834 aa19.77■□□□□ 0.76
CTIF-201ENST00000256413 CCDC173Q0VFZ6 552 aa19.76■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 HMMRO75330 724 aa19.76■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 CCDC34Q96HJ3 373 aa19.76■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 NPHP1O15259 732 aa19.75■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 PKD2Q13563 968 aa19.75■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 NUCB2P80303 420 aa19.75■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 POGKQ9P215 609 aa19.75■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 FMN1Q68DA7 1419 aa19.73■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 COG6Q9Y2V7 657 aa19.73■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 MCTP1Q6DN14 999 aa19.72■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 IFT57Q9NWB7 429 aa19.72■□□□□ 0.75
CTIF-201ENST00000256413 C22orf23Q9BZE7 217 aa19.7■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD45Q5TZF3 282 aa19.7■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 E9PSI1 815 aa19.7■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 HOMER1Q86YM7 354 aa19.69■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 ESPNB1AK53 854 aa19.69■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.68■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 PLEKHG5O94827 1062 aa19.67■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 KIF3AQ9Y496 699 aa19.67■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 BACH2Q9BYV9 841 aa19.66■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa19.66■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 CCDC70Q6NSX1 233 aa19.66■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 UQCRHLA0A096LP55 91 aa19.66■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 UQCRHP07919 91 aa19.66■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 MNS1Q8NEH6 495 aa19.66■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 GRPEL1Q9HAV7 217 aa19.65■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
CTIF-201ENST00000256413 ZMYND15Q9H091 742 aa19.65■□□□□ 0.74
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CTIF-201ENST00000256413 TAF3Q5VWG9 929 aa19.64■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 RNF214Q8ND24 703 aa19.63■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.63■□□□□ 0.73
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CTIF-201ENST00000256413 REC8O95072 547 aa19.63■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 ACBD3Q9H3P7 528 aa19.63■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 H3BQV1 296 aa19.62■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 IFFO2Q5TF58 517 aa19.62■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 HSP90B2PQ58FF3 399 aa19.61■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 CREBRFQ8IUR6 639 aa19.61■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.6■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 TPM1P09493 284 aa19.59■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 PDCL3Q9H2J4 239 aa19.58■□□□□ 0.73
CTIF-201ENST00000256413 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 STK31Q9BXU1 1019 aa19.57■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 DDX19BQ9UMR2 479 aa19.57■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 RILPL2Q969X0 211 aa19.56■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 MBD3O95983 291 aa19.56■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 SASS6Q6UVJ0 657 aa19.56■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 FAM184AQ8NB25 1140 aa19.56■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 CHMP3Q9Y3E7 222 aa19.56■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 RDXP35241 583 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 BICD2Q8TD16 824 aa19.54■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 TSPY26PQ9H489 355 aa19.54■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.54■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 PANK3Q9H999 370 aa19.54■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.54■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 H0YHG0 523 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 AAMPQ13685 434 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 AK7Q96M32 723 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 LEKR1Q6ZMV7 388 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.52■□□□□ 0.72
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN30Q86W11 494 aa19.52■□□□□ 0.71
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