RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 A2MP01023 1474 aa26.37■■□□□ 1.81
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CBX1-201ENST00000225603 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.35■■□□□ 1.81
CBX1-201ENST00000225603 KIF3BO15066 747 aa26.35■■□□□ 1.81
CBX1-201ENST00000225603 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.32■■□□□ 1.8
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CBX1-201ENST00000225603 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.31■■□□□ 1.8
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CBX1-201ENST00000225603 ATP10AO60312 1499 aa26.23■■□□□ 1.79
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CBX1-201ENST00000225603 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.97■■□□□ 1.75
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CBX1-201ENST00000225603 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.67■■□□□ 1.7
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CBX1-201ENST00000225603 C3P01024 1663 aa25.56■■□□□ 1.68
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CBX1-201ENST00000225603 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.51■■□□□ 1.67
CBX1-201ENST00000225603 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
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CBX1-201ENST00000225603 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.51■■□□□ 1.67
CBX1-201ENST00000225603 MYOM2P54296 1465 aa25.51■■□□□ 1.67
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