RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042850.8

Svep1-201, Transcript of Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Svep1, Length 11,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1-201ENSMUST00000042850 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa11.41□□□□□ -0.58
Svep1-201ENSMUST00000042850 Hook1Q8BIL5 728 aa11.41□□□□□ -0.58
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ush1cQ9ES64 910 aa11.41□□□□□ -0.58
Svep1-201ENSMUST00000042850 Drc7Q6V3W6 876 aa11.4□□□□□ -0.58
Svep1-201ENSMUST00000042850 Smc4Q8CG47 1286 aa11.4□□□□□ -0.58
Svep1-201ENSMUST00000042850 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Rundc1Q0VDN7 615 aa11.39□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cgnl1Q6AW69 1298 aa11.39□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa11.39□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 SlkO54988 1233 aa11.39□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Filip1lQ6P6L0 1131 aa11.39□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ap3b2Q9JME5 1082 aa11.39□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Pibf1E9Q6K3 756 aa11.39□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Rsph3aQ3UFY4 516 aa11.39□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa11.39□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Chaf1aQ9QWF0 911 aa11.39□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 AppP12023 770 aa11.38□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ecm2Q5FW85 670 aa11.38□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 March6Q6ZQ89 909 aa11.38□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa11.38□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Map4P27546 1125 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 HmmrQ00547 794 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ppp4r3bQ922R5 820 aa11.38□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gcom1E9PZ54 550 aa11.38□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 MyzapQ3UIJ9 466 aa11.38□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa11.38□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Abcc8B2RUS7 1588 aa11.38□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Taf3Q5HZG4 932 aa11.37□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Zscan21Q07231 555 aa11.37□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ipo9Q91YE6 1041 aa11.37□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ccp110Q7TSH4 1004 aa11.37□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cplx1P63040 134 aa11.36□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Rec8Q8C5S7 591 aa11.36□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Necab1Q8BG18 352 aa11.36□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ksr2Q3UVC0 959 aa11.36□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Chrna2Q91X60 512 aa11.35□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Dctn1O08788 1281 aa11.35□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 UvssaQ9D479 717 aa11.35□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Rock2P70336 1388 aa11.35□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Bcl11aQ9QYE3 773 aa11.34□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa11.34□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Dcaf11Q91VU6 549 aa11.34□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Sycp1Q62209 993 aa11.34□□□□□ -0.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Rsph4aQ8BYM7 716 aa11.33□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa11.33□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 IbspQ61711 324 aa11.33□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Lemd3Q9WU40 921 aa11.33□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Kif3cO35066 796 aa11.32□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 AknaQ80VW7 1404 aa11.31□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ccdc146E9Q9F7 977 aa11.31□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 CenpjQ569L8 1344 aa11.31□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Pkd2O35245 966 aa11.31□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Stk31Q99MW1 1018 aa11.31□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 AcrbpQ3V140 540 aa11.3□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Tceal9Q9DD24 104 aa11.3□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Arid3cA6PWV5 409 aa11.3□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Wdr78E9PYY5 807 aa11.3□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 KinQ8K339 391 aa11.3□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Kif27Q7M6Z4 1394 aa11.3□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Samd1D3YXK1 519 aa11.3□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ripply1Q2WG77 201 aa11.3□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Rnf20Q5DTM8 973 aa11.29□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Kif3aP28741 701 aa11.29□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa11.29□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gpatch3Q8BIY1 525 aa11.29□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Fbxo2Q80UW2 297 aa11.29□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Anp32eP97822 260 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 CrcpO35427 148 aa11.29□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 CalrP14211 416 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Golga3P55937 1487 aa11.28□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Trim29Q8R2Q0 587 aa11.28□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Chmp7Q8R1T1 451 aa11.27□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Commd10Q8JZY2 202 aa11.27□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ralbp1Q62172 648 aa11.27□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Bicd2Q921C5 820 aa11.27□□□□□ -0.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cabp4Q8VHC5 271 aa11.27□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Hmgn5Q9JL35 406 aa11.27□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 A0A0U1RNP2 1173 aa11.27□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Stard8Q8K031 1019 aa11.26□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Exoc6Q8R313 802 aa11.26□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Casq1O09165 405 aa11.26□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Polr3gQ6NXY9 223 aa11.25□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 CrbnQ8C7D2 445 aa11.25□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cep89Q9CZX2 791 aa11.25□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Srcin1Q9QWI6 1250 aa11.25□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Pdcl3Q8BVF2 240 aa11.25□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cwc15Q9JHS9 229 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Dixdc1Q80Y83 711 aa11.24□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Fyco1Q8VDC1 1437 aa11.24□□□□□ -0.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ipo4Q8VI75 1082 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.8 ms