RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	VMA22	P38784	181 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	SEO1	P39709	593 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	JLP2	P40206	208 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	IDP2	P41939	412 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	IRC7	P43623	340 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YGR042W	P53227	271 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YNL140C	P53910	189 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	GPI15	P53961	229 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YDR209C	Q03480	137 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	DLT1	Q04216	342 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	HRD3	Q05787	833 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	PLB3	Q08108	686 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	SUT2	Q12286	268 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	NAM2	P11325	894 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	CLB2	P24869	491 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YER184C	P39961	794 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	ALG8	P40351	577 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YFR057W	P43625	151 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YJR154W	P47181	346 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	VEL1	P53058	206 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YGL117W	P53133	265 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	BUD32	P53323	261 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	HER2	Q03557	464 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	SPC24	Q04477	213 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YET3	Q07451	203 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	ALE1	Q08548	619 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YOR338W	Q99326	363 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	PET20	Q99373	253 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	TPK3	P05986	398 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	MBR1	P23493	339 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	NAM9	P27929	486 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	COX13	P32799	129 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	MRPL6	P32904	214 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YKL097C	P34245	136 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	BMT2	P38278	337 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	APD1	P38281	316 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	FRT2	P39734	528 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YPR003C	P53394	754 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	MSS11	Q03825	758 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	VBA1	Q04301	562 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	ASR1	Q06834	288 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YLR049C	Q12110	428 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	PUT1	P09368	476 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SNF3	P10870	884 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	NUP1	P20676	1076 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	KIN3	P22209	435 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	HMT1	P38074	348 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	IST2	P38250	946 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	RCK2	P38623	610 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	FMP52	P40008	231 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	PMT6	P42934	759 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YLR460C	P54007	376 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YPL077C	Q02831	240 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YDR132C	Q03900	495 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	MUM3	Q08750	479 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	POM33	Q12164	279 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	JLP1	Q12358	412 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	HEM2	P05373	342 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	BAR1	P12630	587 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	MRPL9	P31334	269 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	TOA2	P32774	122 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	CSE1	P33307	960 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	ECM15	P35195	104 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	ROT2	P38138	954 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	RIB5	P38145	238 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	FAA2	P39518	744 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	HMS2	P47175	358 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	TIS11	P47977	285 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	MGA1	P53050	456 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	LST7	P53237	242 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	CPD1	P53314	239 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	GND2	P53319	492 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	SUC2	P00724	532 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	CBS2	P14905	389 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	YCR102C	P25608	368 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	VPH2	P32341	215 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOP1	YOL006C	ZRT1	P32804	376 aa		3.08	□□□□□ -1.92

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