RNA–Protein interactions for RNA: YEL054C

RPL12A, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L12A, yeast

Gene RPL12A, Length 498 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL12A	YEL054C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	MSS11	Q03825	758 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	UBX2	Q04228	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	CDC123	Q05791	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
RPL12A	YEL054C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	HKR1	P41809	1802 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	MRPL9	P31334	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	IES6	P32617	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	COX13	P32799	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	KAE1	P36132	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	YKR073C	P36153	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	YPK3	P38070	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	PEX7	P39108	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	HAT2	P39984	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	FMP52	P40008	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	PHM8	P40025	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	IDP2	P41939	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	SNG1	P46950	547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	PFA5	Q03289	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	PLM2	Q04383	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	PEX10	Q05568	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	LDS2	Q08218	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	MED7	Q08278	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	SNF8	Q12483	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	TOR1	P35169	2470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	OPI3	P05375	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	AMD2	P22580	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	ACB1	P31787	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	SSO1	P32867	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	SPO23	P33757	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	COA1	P40452	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	NDC80	P40460	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	ICE2	P40499	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	TAD2	P47058	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	YJR030C	P47101	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	AZR1	P50080	613 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	YGL204C	P53089	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	YIP4	P53093	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	ATG4	P53867	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	SED5	Q01590	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	FMP30	Q02883	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	MMT1	Q03218	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	OST6	Q03723	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	GRE1	Q08969	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	NPC2	Q12408	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	MXR2	P25566	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	NAM9	P27929	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	VPH2	P32341	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	NUP2	P32499	720 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	NDC1	P32500	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	PDR3	P33200	976 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	NUF2	P33895	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	ROT2	P38138	954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	ARP1	P38696	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	FRT2	P39734	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	YER184C	P39961	794 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	POG1	P40473	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	SAS2	P40963	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	BAP3	P41815	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	SBH2	P52871	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	GTR2	P53290	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	SLG1	P54867	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	MSC1	Q03104	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	ROT1	Q03691	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	TRS23	Q03784	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	GIS1	Q03833	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	DLT1	Q04216	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	TMN2	Q04562	672 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	NAT4	Q04751	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	NDE2	Q07500	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	YEH2	Q07950	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	GSC2	P40989	1895 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL12A	YEL054C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 382.7 ms