RNA–Protein interactions for RNA: YBL093C

ROX3, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene ROX3, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROX3	YBL093C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ROX3	YBL093C	BOP2	Q06150	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ROX3	YBL093C	ARO10	Q06408	635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ROX3	YBL093C	ATG17	Q06410	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ROX3	YBL093C	SWA2	Q06677	668 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ROX3	YBL093C	MMT2	Q08970	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ROX3	YBL093C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ROX3	YBL093C	LAG2	Q92325	660 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ROX3	YBL093C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ROX3	YBL093C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TPK3	P05986	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	CNA1	P23287	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	PRE4	P30657	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SRB5	P32585	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	LOT5	P34234	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TUL1	P36096	758 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	EHT1	P38295	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	GOS1	P38736	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	MNL1	P38888	796 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SPO73	P40031	143 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	COG3	P40094	801 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YJL068C	P40363	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	MSS2	P40990	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	PRM8	P53174	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	CDH1	P53197	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YNL181W	P53878	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SWP1	Q02795	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RIM13	Q03792	727 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RSF1	Q05043	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	STP3	Q05937	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	DCI1	Q08558	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SFM1	Q12314	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RER1	P25560	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YMC1	P32331	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	DAL3	P32459	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	LHS1	P36016	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	UTH1	P36135	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YBR138C	P38277	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	AVT6	P40074	448 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SNM1	P40993	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RSC9	Q03124	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RSN1	Q03516	953 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RNH202	Q05635	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	ENT2	Q05785	613 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	IZH3	Q07959	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RKM5	Q12367	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
ROX3	YBL093C	MRX4	Q12467	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SKS1	Q12505	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	CDC26	P14724	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RPB5	P20434	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	EMP70	P32802	667 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	ELF1	P36053	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	BIG1	P38813	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RCY1	P39531	840 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	LTP1	P40347	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SLD3	P53135	668 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SNF12	P53628	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	COG5	P53951	403 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	SED5	Q01590	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	FDC1	Q03034	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TLG1	Q03322	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	GIS1	Q03833	894 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RRN11	Q04712	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RKI1	Q12189	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	NFI1	Q12216	726 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	HOP1	P20050	605 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	PTR2	P32901	601 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	NUF2	P33895	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ROX3	YBL093C	YKR015C	P36111	568 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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