RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	MRP13	P12686	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ABF1	P14164	731 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ARG1	P22768	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ATG22	P25568	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YPT7	P32939	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SPC34	P36131	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	KAE1	P36132	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	MRPL16	P38064	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ERG28	P40030	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	COX15	P40086	486 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	AAD14	P42884	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SOL1	P50278	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	COG1	P53079	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ZRG17	P53735	605 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	EFM6	P53970	246 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	CDC73	Q06697	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ALE1	Q08548	619 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	FRE3	Q08905	711 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SRL2	Q12020	392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	FLP1	P03870	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SYN8	P31377	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	DGR2	P32330	852 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YEF1	P32622	495 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	RCK1	P38622	512 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	PRE3	P38624	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	NPP2	P39997	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	FIR1	P40020	876 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	MAD2	P40958	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YAR1	P46683	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ARH1	P48360	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	GND2	P53319	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	BOR1	P53838	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	NRK1	P53915	240 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YLR460C	P54007	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	AIM34	Q03673	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	CRR1	Q05790	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	COA4	Q05809	96 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	HRT3	Q12347	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SFG1	Q12507	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	RAD10	P06838	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	HEM15	P16622	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	PDE1	P22434	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	OCH1	P31755	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	MRP20	P32387	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ALP1	P38971	573 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	FMP32	P43557	207 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	MRX5	P47007	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	MOG1	P47123	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	COS1	P53822	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YNL115C	P53925	644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	RAD34	Q06665	692 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SAM3	Q08986	587 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	GLO4	Q12320	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	RGS2	Q99188	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	VCX1	Q99385	411 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SAC7	P17121	654 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SEC59	P20048	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	FPS1	P23900	669 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	STE14	P32584	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SHG1	P38337	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YFL040W	P43562	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	AZR1	P50080	613 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	VPS62	P53285	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	YGR273C	P53329	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	FCY22	Q12119	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	TRM11	Q12463	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	HIS5	P07172	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	ATP10	P18496	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	SPT14	P32363	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PXA1	YPL147W	FLR1	P38124	548 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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