RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR104W	YKR104W	SRL4	Q03085	281 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	URC2	Q04411	772 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	AIM33	Q04516	312 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	REX4	Q08237	289 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	RNH203	Q12338	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	FSH3	Q99369	266 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR104W	YKR104W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	BAR1	P12630	587 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RPB8	P20436	146 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	GPI12	P23797	304 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	LAG1	P38703	411 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	FET3	P38993	636 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YIL060W	P40519	144 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YDL186W	P48568	277 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YGR117C	P53270	476 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	COX20	Q04935	205 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	CTS2	Q06350	511 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	BSC6	Q08280	497 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	IMA2	Q08295	589 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RSF2	P46974	1380 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RAD7	P06779	565 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	CLN3	P13365	580 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	KSS1	P14681	368 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	DAL2	P25335	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	MEI5	P32489	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	IML3	P38265	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	MMS21	P38632	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	ARP1	P38696	384 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SEC9	P40357	651 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	OTU1	P43558	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	TRS85	P46944	698 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YGR168C	P53293	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RET3	P53600	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	MMT1	Q03218	510 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SMP3	Q04174	516 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	EDE1	P34216	1381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YSR3	P23501	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	PRR1	P28708	518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	ACH1	P32316	526 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SRB4	P32569	687 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	CYM1	P32898	989 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	PDR3	P33200	976 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	DOA1	P36037	715 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YBR056W	P38081	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SLX1	P38324	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	DSE1	P40077	573 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YJL118W	P47022	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	STE24	P47154	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	HOP2	P53187	214 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SPP2	Q02521	185 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SCW10	Q04951	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RTT103	Q05543	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SKN1	P33336	771 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	MAL32	P38158	584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YAL037W	P39728	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
YKR104W	YKR104W	MRX5	P47007	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	HMS2	P47175	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	PCP1	P53259	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	GPI1	P53306	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	MAL12	P53341	584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	CRZ1	P53968	678 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RSN1	Q03516	953 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	BNA7	Q04066	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	ASA1	Q06822	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SSK1	Q07084	712 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	ATG34	Q12292	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RAD3	P06839	778 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	DAL81	P21657	970 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	CWP1	P28319	239 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	COX13	P32799	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	MNS1	P32906	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 76.1 ms