RNA–Protein interactions for RNA: YBL039C

URA7, Transcript of Major CTP synthase isozyme (see also URA8), yeast

Gene URA7, Length 1,740 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URA7	YBL039C	GLO2	Q05584	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	DIC1	Q06143	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	GRS2	Q06817	618 aa		4.98	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	UTR1	P21373	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	ACB1	P31787	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	TMT1	P32643	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	PHB2	P50085	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
URA7	YBL039C	TMN2	Q04562	672 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	LSB5	P25369	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	YKL097C	P34245	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	YPK3	P38070	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	LDB7	P38210	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	MKC7	P53379	596 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	NUP100	Q02629	959 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	SRL2	Q12020	392 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA7	YBL039C	RAD1	P06777	1100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	SPO12	P17123	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	POP5	P28005	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	APD1	P38281	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	AGP3	P43548	558 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	AIM24	P47127	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	OKP1	P53298	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	KRE28	Q04431	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	DRS2	P39524	1355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	EXO70	P19658	623 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YMC1	P32331	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YCR041W	P37265	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	IST2	P38250	946 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	PFS1	P38872	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	FAA2	P39518	744 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	FHL1	P39521	936 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	RRN9	P53437	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	FRE4	P53746	719 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	ACF2	Q12168	779 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	MSH5	Q12175	901 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YOP1	Q12402	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	RRI1	Q12468	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	FAR1	P21268	830 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	OMA1	P36163	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YEL020C	P39994	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	COA1	P40452	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	GLG2	P47011	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	HER2	Q03557	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	BET5	Q03630	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	ERP3	Q12403	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	ARP6	Q12509	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	NCB2	Q92317	146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	LAG2	Q92325	660 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	ATG7	P38862	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	VRG4	P40107	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	CSM2	P40465	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	LST7	P53237	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	SPO77	Q06134	477 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	BSP1	Q06604	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	VPS15	P22219	1454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	RBK1	P25332	333 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	DCC1	P25559	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	PHD1	P36093	366 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	RBG1	P39729	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	AZR1	P50080	613 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YNR048W	P53740	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	SED5	Q01590	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	SPR6	Q01684	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	CAC2	Q04199	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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