RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W SEC53P07283 254 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W CTA1P15202 515 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W PHO80P20052 293 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W KRE2P27809 442 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W RPB9P27999 122 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W BEM1P29366 551 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W MRS6P32864 603 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W CMC1P36064 111 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W GPX2P38143 162 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W GGC1P38988 300 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W HXT14P42833 540 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W ASG7P46993 209 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W NAS6P50086 228 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W CDH1P53197 566 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W YNL095CP53932 642 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W STD1Q02794 444 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W YML131WQ03102 365 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W GMC1Q04399 608 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W YDR114CQ04597 100 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W DCR2Q05924 578 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W ARR1Q06596 294 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W FEX1Q08913 375 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W FEX2Q08991 375 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W RCN2Q12044 265 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W ATP16Q12165 160 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W POM152P39685 1337 aa-0.19□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W SCEIP03882 235 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W ADE4P04046 510 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W ALG1P16661 449 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W LDS1P31379 325 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W HXT3P32466 567 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W PTH2P34222 208 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W MUD2P36084 527 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W GPI16P38875 610 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W YFR045WP43617 309 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W CIN2P46670 268 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W UBX2Q04228 584 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W FSH2Q05015 223 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W ECM19Q06011 112 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W YPL264CQ08980 353 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W ATG29Q12092 213 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W HMS1Q12398 434 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W PCL9Q12477 304 aa-0.2□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.21□□□□□ -2.44not detected
RDS3YPR094W ATP1P07251 545 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W YER188C-AP0C0V2 99 aa-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W YAK1P14680 807 aa-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W CLB6P32943 380 aa-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W TIP20P33891 701 aa-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W IES5P40060 125 aa-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W YGR117CP53270 476 aa-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W SPR6Q01684 191 aa-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W INM2Q05533 292 aa-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W VPS68Q12016 184 aa-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W YDR018CQ12185 396 aa-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W VAM3Q12241 283 aa-0.21□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W CLB1P24868 471 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W PMT2P31382 759 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W ARO4P32449 370 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W NIP1P32497 812 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W SSE1P32589 693 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W TIR2P33890 251 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W COS9P36034 407 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W RRN10P38204 145 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W MMS21P38632 267 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W ECO1P43605 281 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W ABM1P47146 123 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W DSK2P48510 373 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W TOS2P50078 622 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W VPS75P53853 264 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W MMT1Q03218 510 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W YDR131CQ03899 556 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W YMR244WQ04018 355 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W CSI1Q04368 295 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W RTN2Q12443 393 aa-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RDS3YPR094W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RPL3P14126 387 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W URA4P20051 364 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W ROX1P25042 368 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W INO2P26798 304 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W BRF1P29056 596 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W GPI10P30777 616 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W MCR1P36060 302 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W MED8P38304 223 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RCK1P38622 512 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W FMS1P50264 508 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RRN9P53437 365 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W SLT2Q00772 484 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YMR166CQ03829 368 aa-0.23□□□□□ -2.45
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