RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	TPP1	Q03796	238 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	URC2	Q04411	772 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	ARP10	Q04549	284 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YLR345W	Q06137	509 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	GUP2	Q08929	609 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YDL211C	Q12121	372 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	VCX1	Q99385	411 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	MET17	P06106	444 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	SIR3	P06701	978 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YCK1	P23291	538 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	MXR2	P25566	168 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	ITR2	P30606	609 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	FAA3	P39002	694 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	RRG9	P40156	214 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	GID8	P40208	455 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	EXG2	P52911	562 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YPL068C	Q02749	293 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	RNH1	Q04740	348 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	SBE22	P38814	852 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YEL068C	P39977	110 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	SMK1	P41808	388 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	RET2	P43621	546 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	TPC1	P53257	314 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	REX3	Q12090	404 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	APC2	Q12440	853 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YPR015C	Q12531	247 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	HFA1	P32874	2273 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	MKK2	P32491	506 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	SRO77	P38163	1010 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YTA6	P40328	754 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	SPG5	P42933	373 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	IRC5	P43610	853 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ASK10	P48361	1146 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	SPT20	P50875	604 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YDR541C	Q03049	344 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	HER1	Q12276	1246 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	AI1	P03875	834 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	HOM3	P10869	527 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	SAM35	P14693	329 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	OAC1	P32332	324 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ECM15	P35195	104 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	EXO84	P38261	753 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ANS1	P38832	159 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	PEX18	P38855	283 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ALP1	P38971	573 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	IDS2	P46958	469 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	HMS2	P47175	358 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	TOS2	P50078	622 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YKR011C	Q02209	353 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YLR446W	Q06204	433 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	SIA1	Q12212	622 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ECM34	P38728	170 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	PZF1	P39933	429 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ALR2	P43553	858 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	SRL4	Q03085	281 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YMR210W	Q03649	449 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	MMP1	Q12372	583 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	PNS1	Q12412	539 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	HO	P09932	586 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ENA1	P13587	1091 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	SNF6	P18888	332 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	GPI12	P23797	304 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	LST4	P34239	828 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ARN2	P38724	620 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	UME6	P39001	836 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YIL067C	P40514	678 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	COS1	P53822	381 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ENA2	Q01896	1091 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	GRX5	Q02784	150 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ARV1	Q06541	321 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	CRT10	Q08226	957 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	TPO4	Q12256	659 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	PSF1	Q12488	208 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ENA5	Q12691	1091 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8

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