RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	ORT1	Q12375	292 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	SEC63	P14906	663 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	PRR1	P28708	518 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	MRP21	P38175	177 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	YHR054C	P38780	354 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	SMF1	P38925	575 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.77	□□□□□ -1.97	not detected
PEX18	YHR160C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	RTN2	Q12443	393 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	RIP1	P08067	215 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	RED1	P14291	827 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	RRT12	P25381	491 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	POP5	P28005	173 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	KKQ8	P36004	724 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	HMT1	P38074	348 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	VHC1	P38329	1120 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	CPR7	P47103	393 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	SRB7	P47822	140 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	YLR287C	Q05881	355 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	GIS3	Q12418	502 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	HAP2	P06774	265 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	SNT1	P25357	1226 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	KAR9	P32526	644 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	SWI3	P32591	825 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	NPL6	P32832	435 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	JNM1	P36224	373 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	SIF2	P38262	535 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	CTM1	P38818	585 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	HMS2	P47175	358 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	RSC1	P53236	928 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	YMR155W	Q03795	547 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	YLR297W	Q05899	129 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	SIL1	Q08199	421 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	PLP2	Q12017	286 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	YRM1	Q12340	786 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
PEX18	YHR160C	PHO13	P19881	312 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	NUP2	P32499	720 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	YBR056W	P38081	501 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	SPT8	P38915	602 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	ASG7	P46993	209 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	COS5	P47187	383 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
PEX18	YHR160C	ADA2	Q02336	434 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	IRC25	Q07951	179 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	SCM3	Q12334	223 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	RMD5	Q12508	421 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	MAS1	P10507	462 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	VPS3	P23643	1011 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	CSG2	P35206	410 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	RFC3	P38629	340 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	DSE1	P40077	573 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	YJR054W	P47114	497 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	PHB2	P50085	310 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	SPO12	P17123	173 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	RAD57	P25301	460 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	TKL2	P33315	681 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	YEL075C	P39972	122 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	GAB1	P41733	394 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	PHO86	P46956	311 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	BET5	Q03630	159 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	PRM6	Q04705	352 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	MDM30	Q05930	598 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	YPR078C	Q06813	372 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	SGT1	Q08446	395 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	GPM2	Q12008	311 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	VPS54	Q12071	889 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	ISN1	Q99312	450 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PEX18	YHR160C	FMP27	Q06179	2628 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98

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