RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CYK3YDL117W FRQ1Q06389 190 aa4.9□□□□□ -1.62
CYK3YDL117W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CYK3YDL117W BER1Q06688 274 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CYK3YDL117W YPR078CQ06813 372 aa4.9□□□□□ -1.62
CYK3YDL117W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
CYK3YDL117W YOR342CQ12182 319 aa4.9□□□□□ -1.62
CYK3YDL117W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CYK3YDL117W REP2P03872 296 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W GAL80P04387 435 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RBK1P25332 333 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W STE50P25344 346 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W CHA1P25379 360 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SOL2P37262 315 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W VHC1P38329 1120 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W AIM22P47051 409 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MOG1P47123 218 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W HOC1P47124 396 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W ALT2P52892 507 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YNR066CP53752 436 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PFA5Q03289 374 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MSC2Q03455 724 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YMR209CQ03648 457 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RKM2Q03942 479 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W GAS2Q06135 555 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W IZH3Q07959 543 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YPR202WQ08993 238 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TPK2P06245 380 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W APE1P14904 514 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W KIN82P25341 720 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W VBA3P25594 458 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W ARO4P32449 370 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data4.9□□□□□ -1.63not detected
CYK3YDL117W UGP1P32861 499 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TOD6P34219 525 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W DOA1P36037 715 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YKL162CP36052 402 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TAE1P38340 232 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SFB3P38810 929 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W KRE29P40026 464 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W LAS21P40367 830 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YGR066CP53242 292 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YPR003CP53394 754 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PEX29Q03370 554 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YML096WQ04489 525 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W NAT4Q04751 285 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W CRF1Q04930 467 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YDR278CQ05612 105 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W ASA1Q06822 443 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SSK1Q07084 712 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-DR3Q12441 440 aa4.9□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W CAP2P13517 287 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PHO81P17442 1178 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W EXO70P19658 623 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W EXG1P23776 448 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SPR1P32603 445 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MNS1P32906 549 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SRB2P34162 210 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TCD2P36101 447 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YPT31P38555 223 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MLH1P38920 769 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W NSE4P43124 402 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W ULI1P43604 169 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PET130P47065 347 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MRPS35P53292 345 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PUS6P53294 404 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W BUD32P53323 261 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W ODC1Q03028 310 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RIM13Q03792 727 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W GIS1Q03833 894 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W CDD1Q06549 142 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RIM20Q12033 661 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YOR022CQ12204 715 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W CBP1P07252 654 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MOD5P07884 428 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SNF4P12904 322 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W ERG9P29704 444 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W FRE1P32791 686 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RPT3P33298 428 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MCH2P36032 473 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W BIG1P38813 335 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SET5P38890 526 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YEL068CP39977 110 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W VFA1P40080 203 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RFC4P40339 323 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W EFM3P47163 339 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YGR035CP53222 116 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MRPL22P53881 309 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TEP1P53916 434 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SLM2P53955 656 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W OAZ1Q02803 292 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W GMC1Q04399 608 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YDR222WQ04925 415 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.5 ms