RNA–Protein interactions for RNA: snR34

snR34, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR34, Length 203 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR34	snR34	YSC83	P32792	385 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	SKT5	P34226	696 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	PAC11	P40960	533 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	HAC1	P41546	238 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	STE24	P47154	453 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	TOS2	P50078	622 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	HAL1	Q01766	294 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	MEH1	Q02205	184 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	PRM6	Q04705	352 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	NDL1	Q06568	189 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	UTH1	P36135	365 aa		4.19	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	ATM1	P40416	690 aa		4.19	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	EGT2	P42835	1041 aa		4.19	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	PMT5	P52867	743 aa		4.19	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	ECM7	Q06200	448 aa		4.19	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	TPK3	P05986	398 aa		4.18	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.18	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	PEX5	P35056	612 aa		4.18	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	URC2	Q04411	772 aa		4.18	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	PRR1	P28708	518 aa		4.17	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	DOA1	P36037	715 aa		4.17	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	PFF1	P38244	976 aa		4.17	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	OXA1	P39952	402 aa		4.17	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	DFG10	P40526	253 aa		4.17	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	BNS1	P50084	137 aa		4.17	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	CRH1	P53301	507 aa		4.17	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	TSA2	Q04120	196 aa		4.17	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	LIP2	Q06005	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	ASA1	Q06822	443 aa		4.17	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	YOP1	Q12402	180 aa		4.17	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	MNL1	P38888	796 aa		4.16	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	ATG18	P43601	500 aa		4.16	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
snR34	snR34	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	MDL1	P33310	695 aa		4.15	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	SPT10	P35208	640 aa		4.15	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	GPX2	P38143	162 aa		4.15	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	MLH1	P38920	769 aa		4.15	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	RRN9	P53437	365 aa		4.15	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	MFG1	Q07684	458 aa		4.15	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
snR34	snR34	CLD1	P53264	445 aa		4.14	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	RTT102	P53330	157 aa		4.14	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	YPR091C	Q06833	770 aa		4.14	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	AAD15	Q08361	143 aa		4.14	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	GEP4	P38812	185 aa		4.13	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	YIP5	P53108	310 aa		4.13	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	YET2	Q04210	160 aa		4.13	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.13	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	JEM1	P40358	645 aa		4.12	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	LDS2	Q08218	356 aa		4.12	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	FCY22	Q12119	530 aa		4.12	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	TOA2	P32774	122 aa		4.11	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	TIR2	P33890	251 aa		4.11	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	ECM8	P38246	354 aa		4.11	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	IPK1	Q06667	281 aa		4.11	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	YDL114W	Q07530	308 aa		4.11	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	PCL9	Q12477	304 aa		4.11	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	SRN2	Q99176	213 aa		4.11	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	IES6	P32617	166 aa		4.1	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	MRP21	P38175	177 aa		4.1	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	YER186C	P40101	306 aa		4.1	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	ERO1	Q03103	563 aa		4.1	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	CDC50	P25656	391 aa		4.09	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	FUN26	P31381	517 aa		4.09	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	OM14	P38325	134 aa		4.09	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	YHR177W	P38867	453 aa		4.09	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	ABM1	P47146	123 aa		4.09	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
snR34	snR34	PUP2	P32379	260 aa		4.08	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	EPL1	P43572	832 aa		4.08	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	MLC1	P53141	149 aa		4.08	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	YDL199C	Q12407	687 aa		4.08	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	SPO23	P33757	523 aa		4.07	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	COX4	P04037	155 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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