RNA–Protein interactions for RNA: YPR165W

RHO1, Transcript of GTP-binding protein of the rho subfamily of Ras-like proteins, yeast

Gene RHO1, Length 630 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RHO1	YPR165W	UBC8	P28263	218 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	PEP12	P32854	288 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	MSN2	P33748	704 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	LOT5	P34234	306 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	TAF14	P35189	244 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	MRPL15	P36523	253 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YIL086C	P40503	102 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RSC9	Q03124	581 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	ARO10	Q06408	635 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	FDH1	Q08911	376 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	SKS1	Q12505	502 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	TSC13	Q99190	310 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	GAL4	P04386	881 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	CDC4	P07834	779 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	FAR1	P21268	830 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RPC82	P32349	654 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	MRPL6	P32904	214 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	TUL1	P36096	758 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	FAA3	P39002	694 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	FAR7	P43592	221 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YNL181W	P53878	407 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RIM13	Q03792	727 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	SIZ1	Q04195	904 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RSF1	Q05043	376 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YOL036W	Q08206	761 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RER1	P25560	188 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	PTP2	P29461	750 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	NUF2	P33895	451 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	BIG1	P38813	335 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	GIP2	P40036	548 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YFL066C	P43538	392 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RAD30	Q04049	632 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	SWA2	Q06677	668 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	DCI1	Q08558	271 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	PIN2	Q12057	282 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	MRX4	Q12467	430 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	SEC39	Q12745	709 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	AAC3	P18238	307 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RPS27B	P38711	82 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	TRR2	P38816	342 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RCY1	P39531	840 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YAR028W	P39548	234 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YRB2	P40517	327 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	AAD10	P47182	288 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	TWF1	P53250	332 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YPL107W	Q02873	248 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	KRE28	Q04431	385 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	ENT2	Q05785	613 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	RIB3	Q99258	208 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	CBS1	P14066	229 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	SEC2	P17065	759 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	APN1	P22936	367 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	CTR86	P25355	563 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	MXR2	P25566	168 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.34	□□□□□ -1.23	not detected
RHO1	YPR165W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	KAP122	P32767	1081 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	PTR2	P32901	601 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YBR285W	P38354	144 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	FMP52	P40008	231 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	SPO73	P40031	143 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YIL152W	P40455	235 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	SNM1	P40993	198 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	TRM9	P49957	279 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	ROM1	P53046	1155 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YGR266W	P53326	701 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	SMA2	Q04658	369 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YPR172W	Q06608	200 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YPR091C	Q06833	770 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	GUP2	Q08929	609 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	YPL066W	Q12194	479 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RHO1	YPR165W	KSS1	P14681	368 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RHO1	YPR165W	DAL82	P21705	255 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RHO1	YPR165W	GSH1	P32477	678 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RHO1	YPR165W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RHO1	YPR165W	YOR062C	P36025	268 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RHO1	YPR165W	VPS51	P36116	164 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RHO1	YPR165W	ECM8	P38246	354 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RHO1	YPR165W	SIC1	P38634	284 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RHO1	YPR165W	MPH1	P40562	993 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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