RNA–Protein interactions for RNA: YOR329C

SCD5, Transcript of Protein required for normal actin organization and endocytosis, yeast

Gene SCD5, Length 2,619 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCD5	YOR329C	TLG1	Q03322	224 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	LOT6	Q07923	191 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	YLR030W	Q07967	263 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	COR1	P07256	457 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	YOL163W	P0CF20	169 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	HAP4	P14064	554 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	YMC1	P32331	307 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	TAF14	P35189	244 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	SRX1	P36077	127 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	SPC42	P36094	363 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	BAP2	P38084	609 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	FES1	P38260	290 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	ARN2	P38724	620 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	YHR177W	P38867	453 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	IPT1	P38954	527 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	YER184C	P39961	794 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	YGL101W	P53144	215 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	SWS2	P53937	143 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	AQR1	P53943	586 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	RSC9	Q03124	581 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	VID22	Q05934	901 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	PDR8	Q06149	701 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	PUN1	Q06991	263 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	YDL114W	Q07530	308 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	GLE1	Q12315	538 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	PNS1	Q12412	539 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	NKP1	Q12493	238 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	LSO1	Q3E827	93 aa		2.21	□□□□□ -2.05
SCD5	YOR329C	DST1	P07273	309 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	MOD5	P07884	428 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	MER1	P16523	270 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	APN1	P22936	367 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	MGR1	P25573	417 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	ARE1	P25628	610 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SUR1	P33300	382 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	MSN2	P33748	704 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	EMC3	P36039	253 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	MRPL15	P36523	253 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	ECM8	P38246	354 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	BIG1	P38813	335 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.21	□□□□□ -2.06	not detected
SCD5	YOR329C	NEO1	P40527	1151 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	MPH1	P40562	993 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	PTR3	P43606	678 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	HMS2	P47175	358 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	ASK10	P48361	1146 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	COS10	P52924	374 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	MNT4	P53745	580 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	CWC24	P53769	259 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	KRE28	Q04431	385 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	RSF1	Q05043	376 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	BNA5	Q05979	453 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	DIC1	Q06143	298 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	BOP2	Q06150	570 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YPR091C	Q06833	770 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YOR365C	Q08844	703 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	UPC2	Q12151	913 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YDR262W	Q12331	272 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SNF8	Q12483	233 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SFG1	Q12507	346 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YOS9	Q99220	542 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	HOM3	P10869	527 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	AAC3	P18238	307 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	NPR1	P22211	790 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SLY41	P22215	453 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	PPH21	P23594	369 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	MEF1	P25039	761 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	CWH43	P25618	953 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SFA1	P32771	386 aa		2.21	□□□□□ -2.06

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