RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PFA4	YOL003C	CPR4	P25334	318 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	CTR86	P25355	563 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	RDS1	P25611	832 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	CAB3	P36076	571 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	FAA2	P39518	744 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	LAM5	P43560	674 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	FRE4	P53746	719 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	GOR1	P53839	350 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	PBA1	Q05778	276 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	RMD5	Q12508	421 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	AFI1	Q99222	893 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	YBL059W	P34224	193 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	RIB5	P38145	238 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	HXT11	P54862	567 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	TAF12	Q03761	539 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	POM152	P39685	1337 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	LSB5	P25369	354 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	NAM9	P27929	486 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	SDH3	P33421	198 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	MRPL10	P36520	322 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	REE1	P40893	198 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	EPL1	P43572	832 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	SOR2	Q07786	357 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	BUG1	Q12191	341 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.23	□□□□□ -1.73	not detected
PFA4	YOL003C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.23	□□□□□ -1.73	not detected
PFA4	YOL003C	YBR137W	P38276	179 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	YAL037W	P39728	267 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	HMS2	P47175	358 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	BTN2	P53286	410 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	TOF1	P53840	1238 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	ACL4	Q03771	387 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	INM2	Q05533	292 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	REX4	Q08237	289 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	TMS1	Q12116	473 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	COQ1	P18900	473 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	URA4	P20051	364 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	CLB1	P24868	471 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	NDT80	P38830	627 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	YGR210C	P42942	411 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	PHO86	P46956	311 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	TOM22	P49334	152 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	GPI15	P53961	229 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	RSN1	Q03516	953 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PFA4	YOL003C	CLN1	P20437	546 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	ERV1	P27882	189 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	SWH1	P35845	1188 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	KKQ8	P36004	724 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	MMS4	P38257	691 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	SDS24	P38314	527 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	PRM5	P40476	318 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	MMR1	Q06324	491 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	PMD1	P32634	1753 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	SLY1	P22213	666 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	BRF1	P29056	596 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	TFB1	P32776	642 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	SLM4	P38247	162 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	RRT2	P38332	387 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	MTC6	P38849	526 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	TCB2	P48231	1178 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	HOT1	Q03213	719 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	BET5	Q03630	159 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	PPM1	Q04081	328 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	DCS1	Q06151	350 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PFA4	YOL003C	MED2	Q12124	431 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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