RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	SPO77	Q06134	477 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MCM21	Q06675	368 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TY2A-B	Q12260	438 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YLR126C	Q12288	251 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	NSI1	Q12457	570 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	INH1	P01097	85 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	HIS5	P07172	385 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	MER1	P16523	270 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	KKQ8	P36004	724 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TPO5	P36029	618 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	YKL151C	P36059	337 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	RRN10	P38204	145 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	FAA3	P39002	694 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	COG3	P40094	801 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	MPM1	P40364	252 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	YFR020W	P43600	232 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	PAC10	P48363	199 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	PRM8	P53174	237 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	NCE103	P53615	221 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	KRE28	Q04431	385 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	FMP42	Q04991	504 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	PLB3	Q08108	686 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	YPL191C	Q08930	360 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	SFM1	Q12314	213 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	SUL2	Q12325	893 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	GPR1	Q12361	961 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	REP1	P03871	373 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	ALG7	P07286	448 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	RHB1	P25378	209 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	CTS1	P29029	562 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	ITR2	P30606	609 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.2	□□□□□ -1.42	not detected
MIA40	YKL195W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	SEC66	P33754	206 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	HCS1	P34243	683 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	AXL2	P38928	823 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	IPT1	P38954	527 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	MET30	P39014	640 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	SOK1	P40317	901 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	YGR201C	P42936	225 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	SNO2	P53823	222 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	COG5	P53951	403 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	SMA1	Q02651	245 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TEN1	Q07921	160 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	YOR389W	Q08912	624 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TRM10	Q12400	293 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	MDM35	O60200	86 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	STE7	P06784	515 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	YCL049C	P25577	312 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	DOM34	P33309	386 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	YKL097C	P34245	136 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	ATG14	P38270	344 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	STP2	P38704	541 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	SPO73	P40031	143 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	AIM20	P40451	204 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	SSU1	P41930	458 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	MRPS18	P42847	217 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	SWP82	P43554	623 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	EFM3	P47163	339 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	ROG1	P53118	685 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	SNF12	P53628	566 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	YNR061C	P53747	219 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	IGO1	P53897	168 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	ROT1	Q03691	256 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TRM82	Q03774	444 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	YDL114W	Q07530	308 aa		6.19	□□□□□ -1.42

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