RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	PCP1	P53259	346 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	HXT11	P54862	567 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	MRP51	Q02950	344 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	CEX1	Q12453	761 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	SEC39	Q12745	709 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	ALG1	P16661	449 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RDS1	P25611	832 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	ITR1	P30605	584 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RPN12	P32496	274 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	MSG5	P38590	489 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	YIP1	P53039	248 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	YPR117W	Q06116	2489 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	GCN4	P03069	281 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	DAL2	P25335	343 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	SPS22	P25380	463 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	AFG1	P32317	509 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	TVP38	P36164	337 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	FIS1	P40515	155 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	LAM5	P43560	674 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	TWF1	P53250	332 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	PGA2	P53903	129 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	CSM3	Q04659	317 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	MMR1	Q06324	491 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	MUM3	Q08750	479 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RTP1	Q12751	981 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	UBR1	P19812	1950 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	ARG3	P05150	338 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	SNA3	P14359	133 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.86	□□□□□ -1.95	not detected
PEX18	YHR160C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	PMT1	P33775	817 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	UTH1	P36135	365 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	SIP3	P38717	1229 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	TVP23	P38962	199 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RMD8	P43620	662 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	YGR149W	P48236	432 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	FUS2	Q05670	677 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	YLH47	Q06493	454 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	SMC6	Q12749	1114 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	PCL1	P24867	279 aa		2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	MNS1	P32906	549 aa		2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	YBR137W	P38276	179 aa		2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	AZR1	P50080	613 aa		2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	SHY1	P53266	389 aa		2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	HST1	P53685	503 aa		2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	HER2	Q03557	464 aa		2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	YDR387C	Q04162	555 aa		2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	MET17	P06106	444 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	CKA2	P19454	339 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RAD14	P28519	371 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	YFL040W	P43562	540 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	IRC6	P43615	237 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	MTM1	P53320	366 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RTC4	P53850	401 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	PPM1	Q04081	328 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	YMR027W	Q04371	470 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	IES4	Q08561	116 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	TRP1	P00912	224 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	COX4	P04037	155 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	RHO2	P06781	192 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	NFT1	P0CE68	1218 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	SLY1	P22213	666 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	OCA4	P25366	362 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	ECM25	P32525	599 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	IME2	P32581	645 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	YSC83	P32792	385 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	SEC66	P33754	206 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	CMC1	P36064	111 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	DRE2	P36152	348 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	VID24	P38263	362 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	YHR131C	P38835	850 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	SSN8	P47821	323 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	RTT102	P53330	157 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	DSL1	P53847	754 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PEX18	YHR160C	YNL146W	P53906	100 aa		2.83	□□□□□ -1.96

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