RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SEM1O94742 89 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CPA1P07258 411 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SEC53P07283 254 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YKR104WP0CE69 306 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SPT15P13393 240 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C POL30P15873 258 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RPB4P20433 221 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C EPT1P22140 391 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TRX2P22803 104 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PHO84P25297 587 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RFA2P26754 273 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CIN8P27895 1000 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RPN2P32565 945 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TFC3P34111 1160 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SRX1P36077 127 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RIM2P38127 377 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YBR032WP38223 100 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C IML3P38265 245 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C EFM1P38732 585 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CYC2P38909 366 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YDR089WP38966 869 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PCF11P39081 626 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CIN4P39110 191 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SCS2P40075 244 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TIF34P40217 347 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PFK26P40433 827 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YFR018CP43599 363 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C FAR3P46671 204 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GCD14P46959 383 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C BOL2P53082 120 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ESF2P53743 316 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C IST1P53843 298 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C UBX4P54730 416 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TGL2P54857 326 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YPL113CQ02961 396 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CCE1Q03702 353 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TAF12Q03761 539 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YMR155WQ03795 547 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ARX1Q03862 593 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CSN9Q03981 162 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C HPT1Q04178 221 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C EMI1Q04406 187 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C HEL2Q05580 639 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C APC9Q12107 265 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YOR012WQ12351 137 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SPE4Q12455 300 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NAG1Q8TGN9 163 aa2.15□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CCH1P50077 2039 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C COX3P00420 269 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C INH1P01097 85 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YAR066WP0CX18 203 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YHR214WP0CX19 203 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YSR3P23501 404 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SNT1P25357 1226 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YCR090CP25654 182 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MSH1P25846 959 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C LAC1P28496 418 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ATP11P32453 318 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PTM1P32857 523 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TIP20P33891 701 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SKT5P34226 696 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SWH1P35845 1188 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YPT52P36018 234 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RRN3P36070 627 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YBR062CP38239 180 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C LEU5P38702 357 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C WSC4P38739 605 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PFS1P38872 237 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CCT6P39079 546 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YHB1P39676 399 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YEL073CP39974 107 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C LSM5P40089 93 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MEP1P40260 492 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C AXL1P40851 1208 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ARC1P46672 376 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TRS85P46944 698 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MAD3P47074 515 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C BIR1P47134 954 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TIS11P47977 285 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C AIF1P52923 378 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CLD1P53264 445 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RCF2P53721 224 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ZRG17P53735 605 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YNL181WP53878 407 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NHP10Q03435 203 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GOT1Q03554 138 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TVP15Q03860 143 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TRM12Q04235 462 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MFB1Q04922 465 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TRI1Q05024 226 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SEC10Q06245 871 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data2.14□□□□□ -2.07not detected
GCN4YEL009C TRM8Q12009 286 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C VPS68Q12016 184 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SRO7Q12038 1033 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MDY2Q12285 212 aa2.14□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
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