RNA–Protein interactions for RNA: YDR289C

RTT103, Transcript of Protein involved in transcription termination by RNA polymerase II, yeast

Gene RTT103, Length 1,230 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTT103	YDR289C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	YHR122W	P38829	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	GUF1	P46943	645 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	SSN8	P47821	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	SHE10	P53075	577 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	AIM33	Q04516	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	TIM18	Q08749	192 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	SRL2	Q12020	392 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTT103	YDR289C	TPK3	P05986	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	CLN3	P13365	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	UGA1	P17649	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	RTC2	P38279	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	PEX18	P38855	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	SPT8	P38915	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YIR016W	P40572	265 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	MRP51	Q02950	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	CEX1	Q12453	761 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	RGS2	Q99188	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	HEM2	P05373	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	MDM10	P18409	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YPS1	P32329	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	PEX2	P32800	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	MNS1	P32906	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	SKT5	P34226	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YKL097C	P34245	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YIR014W	P40570	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	SPO19	Q03029	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	SEG1	Q04279	960 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	RRG8	Q06109	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	VAC14	Q06708	880 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	GEP3	Q08622	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	NCA2	Q12374	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	MAS2	P11914	482 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	IME2	P32581	645 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
RTT103	YDR289C	YKL070W	P36087	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	MRPL37	P36532	105 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	LAM5	P43560	674 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	TOS3	P43637	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	MDV1	P47025	714 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	POP6	P53218	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	SPR6	Q01684	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	SMP3	Q04174	516 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	GLN3	P18494	730 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	CKI1	P20485	582 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	CIN8	P27895	1000 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	BUD2	P33314	1104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	SHO1	P40073	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YJL070C	P40361	888 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	XBP1	P40489	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	GTO1	P48239	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	AVT4	P50944	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YGR117C	P53270	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	RIM13	Q03792	727 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	APC4	Q04601	652 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	ERV41	Q04651	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	RNH1	Q04740	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YOP1	Q12402	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	MRPL8	P22353	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	TRS65	P32893	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	BZZ1	P38822	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	MST28	P39552	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	YMR134W	P40207	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	GCD10	P41814	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTT103	YDR289C	LOH1	P47055	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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