RNA–Protein interactions for RNA: YHR181W

SVP26, Transcript of Integral membrane protein of the early Golgi apparatus and ER, yeast

Gene SVP26, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SVP26	YHR181W	CYC3	P06182	269 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	RAD57	P25301	460 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	SHE10	P53075	577 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	MDG1	P53885	366 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	OAZ1	Q02803	292 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	URH1	Q04179	340 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	VPS54	Q12071	889 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	MED2	Q12124	431 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	ATG34	Q12292	412 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	HRT3	Q12347	344 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	ISA2	Q12425	185 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	PET123	P17558	318 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	JLP2	P40206	208 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	PAN6	P40459	309 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	AIM32	Q04689	311 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	BCH1	Q05029	724 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	MTR10	Q99189	972 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SVP26	YHR181W	DAL2	P25335	343 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	KAR9	P32526	644 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	VHS2	P40463	436 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	YPS6	P40583	537 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	IMA3	P0CW40	589 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	IMA4	P0CW41	589 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	HOM3	P10869	527 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
SVP26	YHR181W	MRPL4	P36517	319 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	SFH5	P47008	294 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	IMA2	Q08295	589 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	UAF30	Q08747	228 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	FDH1	Q08911	376 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	YRM1	Q12340	786 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	SMC6	Q12749	1114 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	SDT1	P53078	280 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	YGR111W	P53265	400 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	AEP3	Q12089	606 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	RBD2	Q12270	262 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	POP5	P28005	173 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	HEL1	P36113	551 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	GAT2	P40209	560 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	PEX25	Q02969	394 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	ADD37	Q03233	198 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	MHR1	Q06630	226 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	SPR1	P32603	445 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	YBR056W	P38081	501 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	CHK1	P38147	527 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	SIM1	P40472	476 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	YML6	P51998	286 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	STD1	Q02794	444 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	MMT1	Q03218	510 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	YLR456W	Q06199	204 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	RAX1	Q08760	435 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	YCL068C	P25593	260 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	CSE2	P33308	149 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	SBE22	P38814	852 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	STN1	P38960	494 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	CHS6	P40955	746 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	MDE1	P47095	244 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	BRO1	P48582	844 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	YLR152C	P54072	576 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	NUP116	Q02630	1113 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	CCE1	Q03702	353 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	RUP1	Q12242	671 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	GPM3	Q12326	303 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	PHA2	P32452	334 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	STP2	P38704	541 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
SVP26	YHR181W	TIS11	P47977	285 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	IRC25	Q07951	179 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	DCI1	Q08558	271 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SVP26	YHR181W	LTV1	P34078	463 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SVP26	YHR181W	YKL097C	P34245	136 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SVP26	YHR181W	MRPL10	P36520	322 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SVP26	YHR181W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SVP26	YHR181W	FAD1	P38913	306 aa		3.08	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.5 ms