RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	YBR139W	P38109	508 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YHR177W	P38867	453 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	RPA14	P50106	137 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	ROG1	P53118	685 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	CIK1	Q01649	594 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	ENA2	Q01896	1091 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	MGR3	Q04472	501 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YLR345W	Q06137	509 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	EAF1	Q06337	982 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	ENA5	Q12691	1091 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	STE7	P06784	515 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	FUS1	P11710	512 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	PUP2	P32379	260 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	QDR2	P40474	542 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	MNT3	P40549	630 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	BIT61	P47041	543 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	TWF1	P53250	332 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	SMA1	Q02651	245 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YMD8	Q03697	442 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	GPI17	Q04080	534 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	KRE28	Q04431	385 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	PDR8	Q06149	701 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	MDM36	Q06820	579 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	REX4	Q08237	289 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	SOG2	Q08817	791 aa		7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	HIS5	P07172	385 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	GSH1	P32477	678 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RIB7	P33312	244 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	MNN2	P38069	597 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YHR033W	P38690	423 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	JLP2	P40206	208 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	PRM10	P42946	383 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	STE24	P47154	453 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	GRX5	Q02784	150 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RSC9	Q03124	581 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	ROY1	Q04847	553 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YOR114W	Q12219	294 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	GPR1	Q12361	961 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	ARN2	P38724	620 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	MET30	P39014	640 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	DDI1	P40087	428 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	ATH1	P48016	1211 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	SNO2	P53823	222 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RIM13	Q03792	727 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	ARO10	Q06408	635 aa		7.82	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	STT4	P37297	1900 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	MSB2	P32334	1306 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	ADE1	P27616	306 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.81	□□□□□ -1.16	not detected
GGA2	YHR108W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	HXT5	P38695	592 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	BIG1	P38813	335 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	FAU1	P40099	211 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	MRPS18	P42847	217 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RET2	P43621	546 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	NUP49	Q02199	472 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	MRX10	Q05648	414 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	DIN7	Q12086	430 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	MED2	Q12124	431 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	NFI1	Q12216	726 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YPR064W	Q12492	139 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	CMP2	P14747	604 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YIM1	P28625	365 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	MKK1	P32490	508 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YKL097C	P34245	136 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	MRPL37	P36532	105 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	FMP23	P38231	175 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RGA1	P39083	1007 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YJL068C	P40363	299 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YJL055W	P47044	245 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RAD17	P48581	401 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	COQ5	P49017	307 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YGR168C	P53293	376 aa		7.8	□□□□□ -1.16

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