RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C VAC7P53950 1165 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SLT2Q00772 484 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C BUD22Q04347 519 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YDR109CQ04585 715 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SWF1Q04629 336 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CDC123Q05791 360 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SFH1Q06168 426 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MCP2Q06567 569 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YET3Q07451 203 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RUD3Q12234 484 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RMD5Q12508 421 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YOR338WQ99326 363 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data2.17□□□□□ -2.06not detected
GCN4YEL009C CBS2P14905 389 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C NSP1P14907 823 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C AMD1P15274 810 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C APA1P16550 321 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C UBA1P22515 1024 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PHO3P24031 467 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SEC14P24280 304 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C LDB16P25587 256 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YCR099CP25657 155 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SPS19P32573 292 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SIP1P32578 815 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CYM1P32898 989 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C STB6P36085 766 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C AVT5P38176 459 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C LDB7P38210 180 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YSW1P38280 609 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C TAE1P38340 232 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SRP72P38688 640 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C LRP1P38801 184 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YHR218WP38899 603 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SSP120P39931 234 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YEN1P40028 759 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PEP8P40335 379 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ALG8P40351 577 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YJR061WP40355 935 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C DSN1P40568 576 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CTK3P46963 296 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SLD3P53135 668 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SWC4P53201 476 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C BIO4P53630 237 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C FRE4P53746 719 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SMA1Q02651 245 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MCH4Q08268 501 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C FRE3Q08905 711 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YLR053CQ12026 108 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C NUS1Q12063 375 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YMR030W-AQ3E760 96 aa2.17□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C STE2D6VTK4 431 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C COX1P00401 534 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SUC2P00724 532 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SRV2P17555 526 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YCR006CP25350 157 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YCR051WP25631 222 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PHA2P32452 334 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RML2P32611 393 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PRP18P33411 251 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C HES1P35843 434 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C TCD2P36101 447 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PHO89P38361 574 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C DBP8P38719 431 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C LIN1P38852 340 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YHR182WP38870 785 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C BAT1P38891 393 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C STN1P38960 494 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C TIM17P39515 158 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C HAT2P39984 401 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SEC28P40509 296 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C IME4P41833 600 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PET130P47065 347 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C LIA1P47120 325 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C COQ5P49017 307 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C NBP35P52920 328 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YGL108CP53139 140 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C BUD32P53323 261 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C HOL1P53389 586 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C OSH6Q02201 448 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SPP2Q02521 185 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RNY1Q02933 434 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YMR209CQ03648 457 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YDR131CQ03899 556 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C TAF11Q04226 346 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RCO1Q04779 684 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C FAR8Q05040 523 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CIA1Q05583 330 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C BLS1Q06071 122 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YLR177WQ06251 628 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C VTA1Q06263 330 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CRN1Q06440 651 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ATG10Q07879 167 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SAM4Q08985 325 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C NCA2Q12374 616 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C GTT2Q12390 233 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RGS2Q99188 309 aa2.16□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MSB2P32334 1306 aa2.16□□□□□ -2.06
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