RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W YOL087CQ99247 1116 aa-0.01□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W RAV1P47104 1357 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W HSC82P15108 705 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W KAR3P17119 729 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W YIH1P25637 258 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W TCD2P36101 447 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W THI2P38141 450 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W VHS2P40463 436 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W COQ5P49017 307 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W MST27P53176 234 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W PEX8P53248 589 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W MIX17Q03667 156 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W YML037CQ03703 340 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W RAD30Q04049 632 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W SNO4Q04902 237 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W MFG1Q07684 458 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W HSP32Q08992 237 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W YOL085CQ99345 113 aa-0.02□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W DAL5P15365 543 aa-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W POL4P25615 582 aa-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W CBP4P37267 147 aa-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W CCT6P39079 546 aa-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W ACA1P39970 489 aa-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W YIL029CP40538 142 aa-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W COS4P43542 379 aa-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W SIP4P46954 829 aa-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W IMD4P50094 524 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W YDR387CQ04162 555 aa-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W VID22Q05934 901 aa-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W BLS1Q06071 122 aa-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W NAG1Q8TGN9 163 aa-0.03□□□□□ -2.41
RDS3YPR094W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ATP10P18496 279 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W PEP3P27801 918 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W PDC2P32896 925 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W XRS2P33301 854 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W FRM2P37261 193 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W MUM2P38236 366 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W TRR2P38816 342 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data-0.04□□□□□ -2.42not detected
RDS3YPR094W CCT2P39076 527 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YER010CP40011 234 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ALG5P40350 334 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YIL059CP40520 121 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YJR008WP47085 338 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W MRM2P53123 320 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W BCH1Q05029 724 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RLM1Q12224 676 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W NYV1Q12255 253 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ORT1Q12375 292 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W CEX1Q12453 761 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RMD5Q12508 421 aa-0.04□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ADH3P07246 375 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RPS23BP0CX30 145 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W DEP1P31385 405 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SIN4P32259 974 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W PHA2P32452 334 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YEF1P32622 495 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SMP1P38128 452 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YHK8P38776 514 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W AXL2P38928 823 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.05□□□□□ -2.42not detected
RDS3YPR094W PET130P47065 347 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ECM27P47144 725 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W BIO3P50277 480 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W VID30P53076 958 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YIF1P53845 314 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YSA1Q01976 231 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W BET5Q03630 159 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W INP2Q03824 705 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W LDS2Q08218 356 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W NBP2Q12163 236 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W FRE8Q12209 686 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W AVL9Q12500 764 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YOR338WQ99326 363 aa-0.05□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W AUS1Q08409 1394 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ILV5P06168 395 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W FUS3P16892 353 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W CMK2P22517 447 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W MSP1P28737 362 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W TKL2P33315 681 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W HAC1P41546 238 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W ARC1P46672 376 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W MNN5P46982 586 aa-0.06□□□□□ -2.42
RDS3YPR094W SFH5P47008 294 aa-0.06□□□□□ -2.42
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