RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YBR053C	P38235	358 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	SIP3	P38717	1229 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YER085C	P40058	173 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	OPT1	P40897	799 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	MSS2	P40990	351 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YIP5	P53108	310 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YGL082W	P53155	381 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	COQ6	P53318	479 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	SNO2	P53823	222 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YNL092W	P53934	400 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	KTR6	P54070	446 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	DLT1	Q04216	342 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	UFO1	Q04511	668 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	RRN11	Q04712	507 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	GSC2	P40989	1895 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	SCEI	P03882	235 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	MET3	P08536	511 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	AMD2	P22580	549 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	SIN4	P32259	974 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	KRE6	P32486	720 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	TRM2	P33753	639 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	PXL1	P36166	706 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	APL3	P38065	1025 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	DUG2	P38149	878 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	VHC1	P38329	1120 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	EFM2	P38347	419 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YHR122W	P38829	231 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	SPC97	P38863	823 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	RCY1	P39531	840 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	SPG5	P42933	373 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	BUD17	P53727	317 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	MSC1	Q03104	513 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	CAB5	Q03941	241 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	GPN3	Q06543	272 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	TEN1	Q07921	160 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	AHC1	Q12433	566 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YOS9	Q99220	542 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YPR089W	O13585	888 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	CDC20	P26309	610 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	SHP1	P34223	423 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	ELF1	P36053	145 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	SLX1	P38324	304 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	PCA1	P38360	1216 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
RPS1B	YML063W	STN1	P38960	494 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	SCC4	P40090	624 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	PAC11	P40960	533 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	OTU1	P43558	301 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	AIM22	P47051	409 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	MUP1	P50276	574 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	PIB2	P53191	635 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	COG2	P53271	262 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	MRPL22	P53881	309 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YNL146W	P53906	100 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	UBP16	Q02863	499 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	ROT1	Q03691	256 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	URC2	Q04411	772 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	GTO3	Q04806	366 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	COQ9	Q05779	260 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	PDR8	Q06149	701 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS1B	YML063W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
RPS1B	YML063W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPS1B	YML063W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPS1B	YML063W	SEC62	P21825	274 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPS1B	YML063W	CNA1	P23287	553 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPS1B	YML063W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPS1B	YML063W	PSO2	P30620	661 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPS1B	YML063W	SRB4	P32569	687 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPS1B	YML063W	REC114	P32841	428 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPS1B	YML063W	SPT10	P35208	640 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPS1B	YML063W	RPC25	P35718	212 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPS1B	YML063W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPS1B	YML063W	DBP8	P38719	431 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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