RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YMD8	Q03697	442 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CIA1	Q05583	330 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YPS7	Q06325	596 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ARR1	Q06596	294 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	NMD4	Q12129	218 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	HSP42	Q12329	375 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	NSI1	Q12457	570 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MHT1	Q12525	324 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YPR096C	O13587	100 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CDC21	P06785	304 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PUT2	P07275	575 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CAP2	P13517	287 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	TFS1	P14306	219 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
UBX7	YBR273C	DBF2	P22204	572 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SFP1	P32432	683 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SPO23	P33757	523 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	LOT5	P34234	306 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CLG1	P35190	452 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ARA1	P38115	344 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	DSF2	P38213	736 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	COS111	P38308	924 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	DBP8	P38719	431 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ATG7	P38862	630 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PET100	P38958	111 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SOK1	P40317	901 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YTA6	P40328	754 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YFL052W	P43551	465 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RET2	P43621	546 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PMT4	P46971	762 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YJR124C	P47159	448 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MPS2	P53159	387 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CPR8	P53728	308 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PRM1	P53835	661 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YNL181W	P53878	407 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	VAC7	P53950	1165 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MET31	Q03081	177 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PLP1	Q04004	230 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MRX10	Q05648	414 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	OPT2	Q06593	877 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	GSH2	Q08220	491 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MNL2	Q12205	849 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
UBX7	YBR273C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	UBR1	P19812	1950 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SWI5	P08153	709 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	KAR1	P11927	433 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	VPS33	P20795	691 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ACH1	P32316	526 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SPT14	P32363	452 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	UIP5	P36137	443 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MBA1	P38300	278 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	GIC1	P38785	314 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	DMA1	P38823	416 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	GDH3	P39708	457 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	JHD1	P40034	492 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PCL6	P40038	420 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	IRC6	P43615	237 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SSY5	P47002	699 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YJR149W	P47177	404 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YGR015C	P53208	328 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PIR1	Q03178	341 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ARG7	Q04728	441 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SPO77	Q06134	477 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	BSP1	Q06604	576 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RSC3	Q06639	885 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	NDD1	Q08887	554 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ACF2	Q12168	779 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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