RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.92□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYOTQ9UBF9 498 aa5.92□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMARCA2P51531 1590 aa5.92□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 CTSWP56202 376 aa5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHRNA2Q15822 529 aa5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 C2orf27AQ580R0 203 aa5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 LBX2Q6XYB7 198 aa5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.91□□□□□ -1.46
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TIMMDC1-209ENST00000498399 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC27A2O14975 620 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 TADA3O75528 432 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 GRK2P25098 689 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 GRK3P35626 688 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
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TIMMDC1-209ENST00000498399 GRIN1Q05586 938 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 CR1LQ2VPA4 569 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 STYK1Q6J9G0 422 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 IFNL3Q8IZI9 196 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRIT1O00522 736 aa5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 GNAT1P11488 350 aa5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 ITGA1P56199 1179 aa5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 NKX3-2P78367 333 aa5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIZQ2M2Z5 673 aa5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 EMC4Q5J8M3 183 aa5.89□□□□□ -1.47
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TIMMDC1-209ENST00000498399 SCUBE1Q8IWY4 988 aa5.89□□□□□ -1.47
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TIMMDC1-209ENST00000498399 IPPKQ9H8X2 491 aa5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 NTMQ9P121 344 aa5.89□□□□□ -1.47
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TIMMDC1-209ENST00000498399 ESYT3A0FGR9 886 aa5.88□□□□□ -1.47
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TIMMDC1-209ENST00000498399 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
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TIMMDC1-209ENST00000498399 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
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TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.88□□□□□ -1.47
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TIMMDC1-209ENST00000498399 CADPSQ9ULU8 1353 aa5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 ENPP3O14638 875 aa5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLSTN1O94985 981 aa5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 LRG1P02750 347 aa5.87□□□□□ -1.47
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TIMMDC1-209ENST00000498399 SQSTM1Q13501 440 aa5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 NFIXQ14938 502 aa5.87□□□□□ -1.47
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TIMMDC1-209ENST00000498399 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.87□□□□□ -1.47
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TIMMDC1-209ENST00000498399 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
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TIMMDC1-209ENST00000498399 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 APPBP2Q92624 585 aa5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 ALG1Q9BT22 464 aa5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 USP40Q9NVE5 1235 aa5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 PEG3Q9GZU2 1588 aa5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAFKO60675 156 aa5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 HSD3B2P26439 372 aa5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1-209ENST00000498399 GUCY1A3Q02108 690 aa5.86□□□□□ -1.47
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