RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W INA22P40576 216 aa8.53□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W VMA13P41807 478 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W EFM5P53200 248 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W SDH1Q00711 640 aa8.53□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W MHT1Q12525 324 aa8.53□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W HXK2P04807 486 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W HEM2P05373 342 aa8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W SPT3P06844 337 aa8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W IDH2P28241 369 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data8.52□□□□□ -1.05not detected
YLR349WYLR349W CCT2P39076 527 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W CCT4P39078 528 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W NDC80P40460 691 aa8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W IRC6P43615 237 aa8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W YJL043WP47053 257 aa8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data8.52□□□□□ -1.05not detected
YLR349WYLR349W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W UPF3P48412 387 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W BPL1P48445 690 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W RAD17P48581 401 aa8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W YPT32P51996 222 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W MSC1Q03104 513 aa8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W REX3Q12090 404 aa8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W KCS1Q12494 1050 aa8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W RGS2Q99188 309 aa8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W Q0010Q9ZZX9 128 aa8.52□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W HMG1P12683 1054 aa8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W DAP2P18962 818 aa8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W PTC6P25646 442 aa8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W RRP14P36080 434 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W BMT2P38278 337 aa8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W REI1P38344 393 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W AIF1P52923 378 aa8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TEL2P53038 688 aa8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W YMR155WQ03795 547 aa8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W PNP1Q05788 311 aa8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W RCN2Q12044 265 aa8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W DYN1P36022 4092 aa8.51□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W ARD1P07347 238 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TY2A-FP0CX61 438 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TY2A-GR2P0CX62 438 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W GPI12P23797 304 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TY2A-CP25383 438 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W PTH2P34222 208 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W SSP120P39931 234 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TED1P40533 473 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W CIN1P40987 1014 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W PDR16P53860 351 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TY2A-DR2Q03483 438 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TY2A-BQ12260 438 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TY2A-OR2Q12293 438 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TY2A-DR1Q12392 438 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TY2A-OR1Q12439 438 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TY2A-DR3Q99303 438 aa8.5□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W MCM1P11746 286 aa8.49□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W MAK32P23060 363 aa8.49□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W PHO87P25360 923 aa8.49□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W ALG3P38179 458 aa8.49□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W YBR071WP38243 211 aa8.49□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W YIL169CP40442 995 aa8.49□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W MDV1P47025 714 aa8.49□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W YNL140CP53910 189 aa8.49□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W YCL012CQ8J0M4 134 aa8.49□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W SPS100P13130 326 aa8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W ART10P18634 518 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data8.48□□□□□ -1.05not detected
YLR349WYLR349W YJL206CP39529 758 aa8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W PEP8P40335 379 aa8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W COA1P40452 197 aa8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W AXL1P40851 1208 aa8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W EMC2P47133 292 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W ZIP2P53061 704 aa8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W BIO4P53630 237 aa8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W ALG12P53730 551 aa8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W MET31Q03081 177 aa8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W MLH3Q12083 715 aa8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W SLP1Q12232 587 aa8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W YOR019WQ99248 730 aa8.48□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W PRT1P06103 763 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W SLY41P22215 453 aa8.47□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W ERG9P29704 444 aa8.47□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W PHA2P32452 334 aa8.47□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W EMP70P32802 667 aa8.47□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W RPC37P36121 282 aa8.47□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W IFA38P38286 347 aa8.47□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W ZRG8P40021 1076 aa8.47□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W RPE1P46969 238 aa8.47□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W TAF11Q04226 346 aa8.47□□□□□ -1.05
YLR349WYLR349W SEC10Q06245 871 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.9 ms