RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR104W	YKR104W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	SPO7	P18410	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	CNA1	P23287	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	SNT1	P25357	1226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	IMG1	P25626	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	YBR144C	P34215	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	PFF1	P38244	976 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	FAD1	P38913	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ASG1	P40467	964 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	LAM5	P43560	674 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	YNL143C	P53908	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	EFM6	P53970	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	MCP2	Q06567	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	SRL1	Q08673	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	MED2	Q12124	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	HNM1	P19807	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	LAC1	P28496	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	NTG1	P31378	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	SPC110	P32380	944 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	LHS1	P36016	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	PIM1	P36775	1133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ARA1	P38115	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	MMS4	P38257	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ELP2	P42935	788 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	PTR3	P43606	678 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	NPA3	P47122	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	COS5	P47187	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	YFH1	Q07540	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	SNA4	Q07549	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	COS7	Q07788	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	INP53	Q12271	1107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ICS2	P38284	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	HSM3	P38348	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	UIP3	P39547	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	YFR018C	P43599	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ARV1	Q06541	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
YKR104W	YKR104W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ARG81	P05085	880 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	SPS4	P09937	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	SPE2	P21182	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	YSP3	P25036	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	NDI1	P32340	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	HES1	P35843	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	MSR1	P38714	643 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	MLH1	P38920	769 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ECM10	P39987	644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	MSY1	P48527	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	YPT11	P48559	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	YGR266W	P53326	701 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	DCS1	Q06151	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	DSE3	Q08729	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	YIM1	P28625	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	KEL2	P50090	882 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	MSC3	Q05812	728 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	RRT8	Q08219	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	MTR10	Q99189	972 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	QCR6	P00127	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	STE3	P06783	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	CBP1	P07252	654 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	BOS1	P25385	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	RAD14	P28519	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	MRP4	P32902	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	COY1	P34237	679 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	OCT1	P35999	772 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ELO1	P39540	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	SSO2	P39926	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ECM27	P47144	725 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72.8 ms